公开数据范围:Chr01–Chr08。 模块和数据版本清单
Salvia miltiorrhiza · Red Sage Omics
Red Sage Omics 是面向丹参参考基因组、多组学注释和预测结果的综合查询平台,目标是把基因、序列、表达、变异、调控、定位、结构域和互作信息整合到同一个可检索入口。
整合 ID 对照、坐标、序列、注释、定位、表达、变异和浏览器跳转。
面向 GO、KEGG、Pfam、InterPro、eggNOG、NR 等注释字段持续扩展。
查询表达量图谱,并基于表达矩阵计算基因间相关性。
包含 Pfam 结构域、亚细胞定位和蛋白互作候选。
包含转录因子结合位点预测和 EMS 功能突变检索。
提供 BLAST、区间取序列、引物候选、JBrowse 和数据下载。
平台论文或正式引用信息确定后,可在这里更新推荐引用格式。当前对外展示建议使用 Red Sage Omics 和 Salvia miltiorrhiza,不使用拼音作为界面品牌。
维护入口:通过服务器 ssh school-server 管理网站服务和数据更新。
西北农林科技大学