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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000245`

染色体: Chr05 坐标: 1875483-1880226 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000245`
名称	SmilChr05G000245
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1875483 - 1880226 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984965`
GeneID	`130984965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984965`
原始查询	`LOC130984965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK3
产物	proline-rich receptor-like protein kinase PERK3
Arabidopsis	`AT5G56790` (AT5G56790) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835781] identity=50.8; qcov=0.53; evalue=1.15e-94; confidence=medium
Rice	`Os01g0602800` (OsRLCK42) - identity=45.3; qcov=0.63; evalue=3.85e-92; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057763650.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057763650.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763650.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763650.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763650.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1875772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B131,B133,D8
`Chr5:1876169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:1876232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,D6
`Chr5:1876270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B140,B93,D7
`Chr5:1876603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:1876610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:1877279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C12
`Chr5:1877537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B113
`Chr5:1877576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C48
`Chr5:1877616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr5:1877632`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr5:1877632`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763650.1

575 aa

288

575

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 302-556 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 303-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763650.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	302	556	8.3e-44	150.7	Protein kinase domain
`XP_057763650.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	303	558	1.6e-43	149.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907667.1
ATTTCACTACAGCTTGTGGCCAAAAACACAGATAAGCAAAACAAAATTCCTTCTTCTCAACATTGAATATACCATTTTCAACTTATTATTGTTGTGTGAGAGAATGAAAATGTCAAAGGGAGGTGAGATTGAGAAGGTGGTGGTGATCCAAACATGCATAGATTTGAGTTGGAGTGAGATGAAATGGTTGCTCAATGCTTTGCCTATAAACCATGGAGATGAAGTCATATTTCTTGGAGTCTTCCAACTCACTAATCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984965
ATGAAAATGTCAAAGGGAGGTGAGATTGAGAAGGTGGTGGTGATCCAAACATGCATAGATTTGAGTTGGAGTGAGATGAAATGGTTGCTCAATGCTTTGCCTATAAACCATGGAGATGAAGTCATATTTCTTGGAGTCTTCCAACTCACTAATCCTTCTACTTCCTCTTTCCTTTCTGCTGCTAAAATTTTGGGATACAAGGGCAAAGAGGATCCATATAAAAATGGATCAATGAGAAAATTGTTGGAGGAAGAAAGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763650.1
MKMSKGGEIEKVVVIQTCIDLSWSEMKWLLNALPINHGDEVIFLGVFQLTNPSTSSFLSAAKILGYKGKEDPYKNGSMRKLLEEERRKKKEEYRQNSGIIKLQEKLQLEKKVKVNVEVAVCTSRRVAGVRAVKRLGATSIILDREMKKEKQYFMDRVSCGISSMKSNNTIVKIRGPINRHVSYDEMIPSYSFEEISPTKSLGKSSFEDISPTKSPEKSSAICSYSVIEDDSKFIGSTSSSKNEASMIKRGNEKGNENYKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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