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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000273`

染色体: Chr05 坐标: 2117926-2122041 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000273`
名称	SmilChr05G000273
描述	guanosine deaminase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2117926 - 2122041 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984997`
GeneID	`130984997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984997`
原始查询	`LOC130984997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	guanosine deaminase
产物	guanosine deaminase
Arabidopsis	`AT5G28050` (AT5G28050) Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832875] identity=86.7; qcov=0.807; evalue=9.22e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0833900` - identity=86.3; qcov=0.816; evalue=3.81e-119; confidence=high
GO	GO:0006152 (purine nucleoside catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0047974 (guanosine deaminase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00383 (dCMP_cyt_deam_1); PF14437 (MafB19-deam)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763701.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763701.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057763701.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763701.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2119263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B3,B42,B97,D9
`Chr5:2119703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:2121470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B2
`Chr5:2121476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B16,B46,D4
`Chr5:2121500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B54,B61,C79,C87
`Chr5:2121732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:2121792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B42,B43,B97,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763701.1

223 aa

112

223

dCMP_cyt_deam_1

MafB19-deam

PF00383 dCMP_cyt_deam_1 67-166 aa PF14437 MafB19-deam 70-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763701.1`	Pfam	`PF00383`	dCMP_cyt_deam_1	Domain	67	166	1.4e-27	96.3	Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region
`XP_057763701.1`	Pfam	`PF14437`	MafB19-deam	Family	70	215	4.5e-21	75.8	MafB19-like deaminase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907718.1
CCGTAGCTTTATATAACTGCACGGCGCTGCCAAATGCCAACCAAACTATAACGTGAAAAATCACACTTTCCGATTCTTTTGGCGTTGCCACCATTACAAACATCCTTCAGATCTCTCTCTCTCTCTCACTAGATCAATTGTTTCACTAATCCATCATTTTACCAGGAAATCCAATTCACATCGCCGATGGAAGAAGCTAAAGTTGTTGAGGTTAAAGACGGAACTACGGCTGCATTCACTCCTCATCAAGAAGTTATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984997
ATGGAAGAAGCTAAAGTTGTTGAGGTTAAAGACGGAACTACGGCTGCATTCACTCCTCATCAAGAAGTTATTGAAGCTAAAGATGGAGATATCTCTGTTCCTACTGCATTTTCTGGTCATCAAGAAGTTGTTGACGCCAAAGATGGAACTATCTCAGTGGCTTCTGCATTTCCTGGTCATCAAGAAGCGGTTCAGGATAGAGATCACAAATTCTTGACAAAAGCAGTTGAAGAGGCGTACAAAGGTGTAGATAGTGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763701.1
MEEAKVVEVKDGTTAAFTPHQEVIEAKDGDISVPTAFSGHQEVVDAKDGTISVASAFPGHQEAVQDRDHKFLTKAVEEAYKGVDSGDGGPFGAVVVQNDEVVVSCHNLVLKHTDPTAHAEVTAIREACKKLNRIELSDCEIYASCEPCPMCFGAIHLSRIKRLVYGAKAEAAIAIGFDDFIADALRGTGFYQKAHLEIKRADGNGAMIAEQVFEKTKEKFQLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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