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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000480`

染色体: Chr05 坐标: 3741736-3751258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000480`
名称	SmilChr05G000480
描述	dammarenediol II synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3741736 - 3751258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985207`
GeneID	`130985207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985207`
原始查询	`LOC130985207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dammarenediol II synthase-like
产物	dammarenediol II synthase-like
Arabidopsis	`AT1G78960` (LUP2) lupeol synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844236] identity=57; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0139700` (OsOSC2) - identity=51.8; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005811 (lipid droplet); GO:0016104 (triterpenoid biosynthetic process); GO:0042300 (beta-amyrin synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13243 (SQHop_cyclase_C); PF13249 (SQHop_cyclase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057764020.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057764020.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764020.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764020.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3743150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:3743390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B29,B70,C83
`Chr5:3743494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:3743771`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A2,B109,B131,B64,B69,C39,C41,C62,C74,C81
`Chr5:3743856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B5,B51
`Chr5:3743958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C11,C69
`Chr5:3744070`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:3744070`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:3744223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B5,C14,C35
`Chr5:3744224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A20,B112,B114,B118,B20,B45,B47,B75,C21,C3,C38,C45,C56,C61
`Chr5:3744233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:3745253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764020.1

767 aa

384

767

SQHop_cyclase_N

SQHop_cyclase_C

PF13249 SQHop_cyclase_N 106-400 aa PF13243 SQHop_cyclase_C 420-759 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764020.1`	Pfam	`PF13249`	SQHop_cyclase_N	Repeat	106	400	5.6e-41	141.4	Squalene-hopene cyclase N-terminal domain
`XP_057764020.1`	Pfam	`PF13243`	SQHop_cyclase_C	Repeat	420	759	4.9e-56	190.8	Squalene-hopene cyclase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908037.1
AGTATTTCAGCTTACCAAAACACGGAAGAAAAAAAAATGTGGTGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCGTATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGGCGGAGGAGCGGGAAGCGCAGCTCGTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCAAGAACAGGAAGAAGGGGTTCCATTCATGCGGCGACTTGTTCATGAGACTGCAGCTCAAAAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985207
ATGTGGTGGCTGAAGATCGCAGAGGGCCACGGCCCGTATCTGTACAGCACGAACAACTTCGTCGGCCGGCAAATATGGGAGTACGACGAGAACGCCGGCACGGCGGAGGAGCGGGAAGCGCAGCTCGTCGATTTCCAGAAGGCTCGCGACGACTGGAGCAAGAACAGGAAGAAGGGGTTCCATTCATGCGGCGACTTGTTCATGAGACTGCAGCTCAAAAGGGAAAGCGGAATCGATCTGCTCGGAATCCCGCCGGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764020.1
MWWLKIAEGHGPYLYSTNNFVGRQIWEYDENAGTAEEREAQLVDFQKARDDWSKNRKKGFHSCGDLFMRLQLKRESGIDLLGIPPVRIGEDEEISYEAATTAVKKALRVNRAVQASDGHWPAENAGPLFFTPPLLISLYISGMLNKVLTPAHIKELIRFIYNHQNEDGGWGFYIEGHSTMIGSALSYVALRILGQEPNDGDGDGAMGRGRQWILDHEGATGIPSWGKLYLSVLGVYEWDGCNPLPPEFWLFPSVFPYHPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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