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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000570`

染色体: Chr05 坐标: 4278904-4284600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000570`
名称	SmilChr05G000570
描述	exonuclease 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4278904 - 4284600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985241`
GeneID	`130985241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985241`
原始查询	`LOC130985241`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exonuclease 1
产物	exonuclease 1
Arabidopsis	`AT1G29630` (AT1G29630) 5'-3' exonuclease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839840] identity=50.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0777300` (OsEXO1) - identity=69.6; qcov=0.557; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0017108 (5'-flap endonuclease activity); GO:0035312 (5'-3' DNA exonuclease activity); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil03430 (Mismatch repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00752 (XPG_N); PF00867 (XPG_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764075.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057764075.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057764075.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057764075.1`
5	PML body	PML body	0.20000	`XP_057764075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4280652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:4280655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:4281242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B61,B8,C73
`Chr5:4281402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B58,B65,C37
`Chr5:4281440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B14
`Chr5:4281675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,D11
`Chr5:4282444`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr5:4282444`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr5:4282452`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr5:4282452`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr5:4282467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:4282598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764075.1

715 aa

358

715

XPG_N

XPG_I

PF00752 XPG_N 1-98 aa PF00867 XPG_I 141-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764075.1`	Pfam	`PF00752`	XPG_N	Family	1	98	6.6e-25	88.2	XPG N-terminal domain
`XP_057764075.1`	Pfam	`PF00867`	XPG_I	Family	141	226	3.4e-22	79.3	XPG I-region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908092.1
TTCCGAGTTCCCTTCCCTCCCTTTATAGCGGGGTTACCAAAATCCCCAACAATTTCAAGTTTGGGGCCCTAATTTCGAAGACTAAGGTTTCTGTTTAGCGCAAGAAGCTCAATAAGATTTCGCACCGGTCTGCAATTGTCAAGAAAGCATTTTGTTGGCCTTTCTTGAGTTCTCGATCAAGTTTGGCGATGGGTATCCAAGGGTTGCTGCCGCTTTTGAAATCAATCATGAATCCGATTCACATTAAGGAGCTGGAGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985241
ATGGGTATCCAAGGGTTGCTGCCGCTTTTGAAATCAATCATGAATCCGATTCACATTAAGGAGCTGGAGGGGTGTTTTGTTGCTATCGATACGTATTCTTGGCTGCACAAAGGCGCTCTTTCTTGCAGCACCGATCTCTGCAAAGGCCAACCCACATCCAAGCACATTAACTACTGCATGCACAGAGTGAATATGCTCCGTCATTATGGTGTCAAACCCATTCTTGTATTTGATGGGGGTCCTCTACCAATGAAGAGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764075.1
MGIQGLLPLLKSIMNPIHIKELEGCFVAIDTYSWLHKGALSCSTDLCKGQPTSKHINYCMHRVNMLRHYGVKPILVFDGGPLPMKSEQEVKRARSRRENLSRAMEHESNGNLTAAYDCYQKAVDISPSIAYDLIQVLKHENVSYIVAPYEADAQMTFLAVSKHVEAVITEDSDLIAFGCPRIIYKMDKFGQGVEFKNAKLQHNKELNLEGFTQMMLLEMCILSGCDYLPSLPGMGLKKAHALMKKFKNHENVIKHLKYSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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