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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002637`

染色体: Chr01 坐标: 44659943-44665690 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002637`
名称	SmilChr01G002637
描述	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44659943 - 44665690 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985374`
GeneID	`130985374`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985374`
原始查询	`LOC130985374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
产物	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
Arabidopsis	`AT2G07750` (AT2G07750) DEA(D/H)-box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815422] identity=55.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0826100` (OsRH48) - identity=62.3; qcov=0.68; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985374

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057764316.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057764316.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057764316.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764316.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764316.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44661268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B14,B49,C22,C54
`Chr1:44661358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B113,B25,B56,B96
`Chr1:44662398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65
`Chr1:44662857`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B32,B77
`Chr1:44662857`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B32,B77
`Chr1:44663034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:44663077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:44663099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B128,C78
`Chr1:44663103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65
`Chr1:44663322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65
`Chr1:44663461`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	B105,B125,B128,B132,B23,B24,B71,B77,B79,B8,B80,B88,B89,C14,C17,C2,C34,C45,C5,C52,C69,C72,C73,C81,D1
`Chr1:44663495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B138,B53,B68,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764316.1

827 aa

414

827

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 382-560 aa PF00271 Helicase_C 605-711 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764316.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	382	560	7.9e-43	146.8	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057764316.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	605	711	2.3e-22	80.0	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908333.1
AAGAAGTTGGCAATTCTTAAACCCTAAACCCTGGAGCAAACAATTTTTCCAAATTCAAAAAATGCATTTCGCCTCTATTTTTCTCCACACTCATTCCAAATCACTCCGCCACAGACTCACATTTCTCCGCCGCATGGGCGGCGGCCCTCGGACGTTTCCCGGCGGGATCAACAAGTGGCAGTGGAAGCGCTTGCACGAGAAGAAAGCCCGAGAGAAAGAGAAACGTCTTCTCGAACAAGAAAAGCAACTCTATCAGGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985374
ATGCATTTCGCCTCTATTTTTCTCCACACTCATTCCAAATCACTCCGCCACAGACTCACATTTCTCCGCCGCATGGGCGGCGGCCCTCGGACGTTTCCCGGCGGGATCAACAAGTGGCAGTGGAAGCGCTTGCACGAGAAGAAAGCCCGAGAGAAAGAGAAACGTCTTCTCGAACAAGAAAAGCAACTCTATCAGGCTAGAGTTCGCTCCGAAATCCGGGCCAAAGTCGCCGCTGCTGAAAACCCTGGTTTCGCCCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764316.1
MHFASIFLHTHSKSLRHRLTFLRRMGGGPRTFPGGINKWQWKRLHEKKAREKEKRLLEQEKQLYQARVRSEIRAKVAAAENPGFAPEKPRQNQPNYGPMTPEEHIKALADRFMKEGAEDLWNENDGPLTVPVNKTGKSRFLGDPINLQKLIAERSISNGGEKIQKSHLFGNISVGVAKPRRFSTYARWGDNLMGGIGNEYFGKMNNGLNLMGNPKLGGLIGVSNLLNSNCYYSVDAARAKSKRLNFVRNSEKSVVKDGLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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