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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000876`

染色体: Chr05 坐标: 6942134-6946093 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000876`
名称	SmilChr05G000876
描述	sphingosine kinase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6942134 - 6946093 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985590`
GeneID	`130985590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985590`
原始查询	`LOC130985590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphingosine kinase 1
产物	sphingosine kinase 1
Arabidopsis	`AT4G21540` (SPHK1) sphingosine kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828239] identity=62.2; qcov=0.997; evalue=3.36e-134; confidence=high
Rice	`Os01g0782200` - identity=51; qcov=1.01; evalue=4.71e-104; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane); GO:0016301 (kinase activity); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0046512 (sphingosine biosynthetic process)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00781 (DAGK_cat); PF19279 (YegS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057764637.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057764638.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057764637.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057764637.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057764637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6942288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B24
`Chr5:6942978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:6944214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:6945768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6945777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C9
`Chr5:6945845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764637.1

483 aa

242

483

DAGK_cat

YegS_C

PF00781 DAGK_cat 107-240 aa PF19279 YegS_C 361-450 aa

XP_057764638.1

300 aa

150

300

YegS_C

PF19279 YegS_C 178-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764637.1`	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	107	240	5.3e-28	97.8	Diacylglycerol kinase catalytic domain
`XP_057764637.1`	Pfam	`PF19279`	YegS_C	Domain	361	450	8.2e-12	45.8	YegS C-terminal NAD kinase beta sandwich-like domain
`XP_057764638.1`	Pfam	`PF19279`	YegS_C	Domain	178	267	3.8e-12	46.9	YegS C-terminal NAD kinase beta sandwich-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908654.1
GAACCTTCCTAAAAAAAGTGATTAATTATTAAGAAAACCTTTCCATCAAAAAACAATTAACAAAACCATTCGACCAACCACCAAAGCGGAGAATCCAAATCCAACAGCAACAAGAATCAAACGATTGTATGATTTGGGCCGAGCTGAGTAGAATTACCTCATAGTGATTGAATTGAATGGAGCAGGAAGAATATATATTGTCGGACCACGTACGCACCAACGGCCTTACAACAACGGCGACTCTTTCCGCCAGCGGTCAA...

XM_057908655.1
AGGAGTATCTAGATTCTCTCGGCCGAAGCGGCTGTTTATATTTGTGAATCCCTACGGAGGGAAGAAATCGGCGTTGAAGATTTTTAAAGACGATGTGAAGCCCTTACTCGATGATGCGAGTGTGGAATATACTATACAAGAAACCAAACACCAGCTGCACGCGAAGGAAGTCGCTCAGTCGCTGGATCTGGAAAAATTTGATGGAATCGTTTGCGTTAGTGGAGATGGAATTCTGGTTGAGGTGCTGAATGGACTGCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985590
ATGGAGCAGGAAGAATATATATTGTCGGACCACGTACGCACCAACGGCCTTACAACAACGGCGACTCTTTCCGCCAGCGGTCAACTCCGCTGGGAAGACCGCCGGCTGGACATCGAGAAGCAGGTATTAGGTTTCTCTGTCGAGGGATTGAAGATCAAAATTAGAACGGTTGTGGAAGCTGAAGCTGGAATATGCTGCTGCACTAGTAAATCCGCCCTCATCAGGAAAACCTTCATACTCGAGCTATCATCGACTGATTC...

LOC130985590
ATGAGGGAGGATTGGGAAAATGCAATAACGATACCTCTTGGAGCAGTACCCGCAGGAACTGGAAATGGCATGGCAAAATCGCTTCTAGATTCACATGGTGAACCATGTGCAGCATCTAATGCTGCTCTTTTTATCATTCGAGGGCATAAGCGGTCACTGGATATAGCTACTATATCACAAGGGGAAACTAGATTTTTTAGCATGTTAATGCTGGCATGGGGTCTTGTAGCTGATATTGATATTGAGTCGGAGAAATACAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764637.1
MEQEEYILSDHVRTNGLTTTATLSASGQLRWEDRRLDIEKQVLGFSVEGLKIKIRTVVEAEAGICCCTSKSALIRKTFILELSSTDSLRIWTEKLQEYLDSLGRPKRLFIFVNPYGGKKSALKIFKDDVKPLLDDASVEYTIQETKHQLHAKEVAQSLDLEKFDGIVCVSGDGILVEVLNGLLMREDWENAITIPLGAVPAGTGNGMAKSLLDSHGEPCAASNAALFIIRGHKRSLDIATISQGETRFFSMLMLAWGLVA...

XP_057764638.1
MREDWENAITIPLGAVPAGTGNGMAKSLLDSHGEPCAASNAALFIIRGHKRSLDIATISQGETRFFSMLMLAWGLVADIDIESEKYRWMGSARLDFYALQRIFGLRRYNGSIIFVPASGYESYGEPLDLEKNIIIVDESAKKSVDGVVRDPAYGYQGPLVDIKSLNWRMIDGPFISIWLHNVPWGGEDTKAAPDAEFSDGCLDLIMIKESPKLPLLKLMTELNSGGHVKSPYVSYLKVKAFILQPGPRTDDPTKAGIIDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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