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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001137`

染色体: Chr05 坐标: 9501820-9506282 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001137`
名称	SmilChr05G001137
描述	subtilisin-like protease SBT2.4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9501820 - 9506282 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985838`
GeneID	`130985838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985838`
原始查询	`LOC130985838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT2.4
产物	subtilisin-like protease SBT2.4
Arabidopsis	`AT1G62340` (ALE1) PA-domain containing subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842532] identity=58.41; qcov=0.99; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os06g0700000` (OsSub52) - identity=42.37; qcov=0.986; evalue=0.0; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985838

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057764971.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057764971.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057764971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9502350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C76
`Chr5:9502426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:9502540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B37,B8,C46,C71
`Chr5:9502886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B68,C48
`Chr5:9504378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:9504417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:9504444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:9504498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:9504764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B38,B39
`Chr5:9505004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:9505607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B140,B76,C53,C85
`Chr5:9505613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764971.1

807 aa

404

807

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 46-117 aa PF00082 Peptidase_S8 142-627 aa PF17766 fn3_6 708-802 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764971.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	46	117	6.8e-11	43.4	Peptidase inhibitor I9
`XP_057764971.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	142	627	1.2e-41	143.7	Subtilase family
`XP_057764971.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	708	802	2.5e-15	57.2	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908988.1
TAATTAAAGGCTGAGGAAATTCTAATTACGAAGAAATAATTTTTCCAGAAAAAGGCAGTTTAAAATTGCAGAAGAAAAGGGTAGAGTGACACTTGTCGAAGAAATGAGCTGTGATTCAAGAAATGATTCATGGAGTTTTTCAAACTAAGTTGTTTGTATAGCGTGAGCAAATTAAACACACCCTTAGTTTACGGATTCGAACGCAAAAAGCAAATTCAACAAAGTTAACGTTGCTCCTCTAAATATTTGTTTTTTCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057764971.1_26514
ATGGTAACTGAGAGAAGCCTAGTTGTGATTCTCTTGTGTGCCTACATTGCTTCTTCTTCCATTGCCGAAGATCGAGACATATATCTAGTTATACTCGAAGGCGAGGGCGTTGCATTCCATCAACAAACACGCCATGACCAGAAACAAGCAAAGAAGAATCATGCAGAATTGTTGGTGGAGTCCCACAATGAGTTTCTCTTGAGCAATCTGGATGCCGGCAGCTACGAGAAGCTGTACAGCTACAAACACGTCGTGAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764971.1
MVTERSLVVILLCAYIASSSIAEDRDIYLVILEGEGVAFHQQTRHDQKQAKKNHAELLVESHNEFLLSNLDAGSYEKLYSYKHVVSGFAVHTSPSQVEKLKGARGVRVVEKDKGAKLMTSYSPQYLGVEEVWSQQGGDANAGDGIVIGFVDSGINPSHPSFAYDPMKPWSSNATRFSGGCEGGPLFPTTSCNGKIISARFFASGAQAAATLNPSIDIMSPYDAVGHGSHVASTAAGNHGVPVVVDGFFYGRASGMAPRAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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