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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002701`

染色体: Chr01 坐标: 45283580-45295750 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002701`
名称	SmilChr01G002701
描述	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45283580 - 45295750 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985952`
GeneID	`130985952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985952`
原始查询	`LOC130985952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
产物	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
Arabidopsis	`AT1G51980` (AT1G51980) Insulinase (Peptidase family M16) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841627] identity=63.2; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0739000` - identity=68.5; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006508 (proteolysis); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00675 (Peptidase_M16); PF05193 (Peptidase_M16_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057765173.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057765173.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057765173.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765173.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45283873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr1:45283915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B44,B59,C37,C43
`Chr1:45286164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:45286497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:45287516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C35
`Chr1:45287546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B56,B96
`Chr1:45287702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765173.1

512 aa

256

512

Peptidase_M16

Peptidase_M16_C

PF00675 Peptidase_M16 85-227 aa PF05193 Peptidase_M16_C 237-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765173.1`	Pfam	`PF00675`	Peptidase_M16	Family	85	227	3.9e-42	144.4	Insulinase (Peptidase family M16)
`XP_057765173.1`	Pfam	`PF05193`	Peptidase_M16_C	Domain	237	420	1.1e-29	104.3	Peptidase M16 inactive domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909190.1
CCAAAAGAAATTATATTATGTCGCACGTGTAAATACAAGAGAGAAACATGCACTTGTCACGTGTGGGGATCCTCATTCCCCGTTGTCTCCACAATTAACAAATTTCGTAGTCTAGCGTCACTACTTCTTCCCAAACCCTCTCCATTTCTCTCCTTTTCCTCTCACCTTTCACCCTTGCATACACAAATTCCCATCTTGTGTGTCCGCGATCGCCCATCCCCTTCAAAGTATGTACAGAACGGCGTCATCTCGCCTCAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985952
ATGTACAGAACGGCGTCATCTCGCCTCAGGGCTCTCAAGGCCAGAACAGGGTGTAGAGGATTGGCTAGATATGCAAGTACAAGTGCTGTTGCAACTAAATCATCTGGAGGTCTCTTTAGTTGGTTGACTGGGGAGAAGTCATCTTCACTTCCACCACTAGACTTTCCGCTTGAGGATATTGTACTTCCCCCTCCATTGCCAGACTATGTTGAGCCTGGGAAGACCAAGATAACCACTCTTCCAAATGGCCTCAGAATAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765173.1
MYRTASSRLRALKARTGCRGLARYASTSAVATKSSGGLFSWLTGEKSSSLPPLDFPLEDIVLPPPLPDYVEPGKTKITTLPNGLRIASETSANPAASIGLYVDSGSIYENPASYGVTHLLERMAFKSTTNRSHLRTVREVEAIGGNVIASASREHMSYTYDALKTYVPQMVELLVDCVRNPAFLDWEVNEQLLKVSAEISEYSKNPHHLLLEAIHSTGYAGAYANGLLASEAALSRLNSTVLEDFVSEHYTAPRIVLAAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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