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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001302`

染色体: Chr05 坐标: 11246094-11249794 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001302`
名称	SmilChr05G001302
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 36
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11246094 - 11249794 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986001`
GeneID	`130986001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986001`
原始查询	`LOC130986001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 36
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 36
Arabidopsis	`AT1G16280` (RH36) RNA helicase 36 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838197] identity=64.2; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0633500` (OsRH36) - identity=61.7; qcov=0.871; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765238.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057765238.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765238.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765238.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11247976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B51,B52,B62,B81
`Chr5:11248638`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B78
`Chr5:11248638`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B78
`Chr5:11249271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:11249443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B101,B24,B54,C35
`Chr5:11249455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr5:11249469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B67,B77
`Chr5:11249492`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B119,B122,B135,B138,B17,B26,B35,B41,B78,B86,C40,C5,C58,C7,C84
`Chr5:11249494`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B11,B110,B114,B125,B28,B42,B53,B66,B72,B75,B84,B87,B93,C17,C24,C32,C45,C46,C68,D4,D8
`Chr5:11249515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B76,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765238.1

489 aa

244

489

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 78-246 aa PF04851 ResIII 95-241 aa PF00271 Helicase_C 289-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765238.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	78	246	1.9e-46	158.6	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057765238.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	95	241	9.5e-07	29.6	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057765238.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	289	393	2e-30	106.0	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909255.1
TCCACTACTAGTAGTTTTGATGAGAGAGGAGGAGTATTTTTAATTTGTTATTTATGAGGGTTTAAGGGTAACGTATACGCTGTGCGCCGTTGCTTCCACGTCGCCGTCGCCGTCGCCGCCAAGGGTCTCTGCCGCTCTACGCGGGCGCTGTTTCCAGCAGTTGAAGTGCTTCTCCCTTCCCAGATTCTTCCAAACCCCCAATTTAATTTGTTGTGCATCTATTAGGGTTAAAGAGCTTAGCAACCATGAATGAAGTAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986001
ATGAATGAAGTAATCGAACTTGACGAAAACTTCCCATTGTTCTCCCGGAAAAAAAGGAAACCAACCACAACAAGCGCCGCCAGCCAGAAGCCCCCGCCATCAGAAACCAGCGTGAAGGTGCTGGAGAAAGAACTAAACCCCAACCCTACGCCGTCGCACATCACCTTCACCGACCTAGGGCTGGCGGAATGGGCCGTGAACACCTGCAAGGAGCTCAAGATGAAGCAGCCCACTCCAGTCCAGTACCACTGCATCCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765238.1
MNEVIELDENFPLFSRKKRKPTTTSAASQKPPPSETSVKVLEKELNPNPTPSHITFTDLGLAEWAVNTCKELKMKQPTPVQYHCIPKILAGRDVLGLAQTGSGKTAAFVLPILHRLAEDPYGVFALVVTPTRELAHQLADQFRALGSGLGLRCVEIVGGMDMITQSRSLIQRPHVVVATPGRIKFLIEQNPDIPAIFSKTKFLVLDEADRVVDINFEAELRVIFQCLPKKRQTLLFTATMSSNLQTILELSANKAYFYAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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