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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001311`

染色体: Chr05 坐标: 11301955-11304810 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001311`
名称	SmilChr05G001311
描述	phosphoglycerate kinase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11301955 - 11304810 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986011`
GeneID	`130986011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986011`
原始查询	`LOC130986011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycerate kinase, chloroplastic
产物	phosphoglycerate kinase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G56190` (AT1G56190) Phosphoglycerate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842072] identity=86.3; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0496200` (OsPGK3) - identity=86.6; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004618 (phosphoglycerate kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006094 (gluconeogenesis); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00162 (PGK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765249.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057765249.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765249.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765249.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11302386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:11302552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:11303368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B112
`Chr5:11303386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C70,D11
`Chr5:11304225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765249.1

475 aa

238

475

PGK

PF00162 PGK 81-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765249.1`	Pfam	`PF00162`	PGK	Domain	81	459	4.2e-165	550.0	Phosphoglycerate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909266.1
CTAAAAAGAAACCAAAAAATGGTGGGAAGAAACTATACGGCGAAAGATGAATAAAAAAGTTGGAAAGGCAAAGAAAACAGGACAAGAAGAGAGTGAACCTGAAAATCATCGAACATCTTCAACCTCAACCTCAACTCGACGATAAGAGAAATCTCAATCCCATACCACAAACACCCACACCCACCCACCACTTCACTTTCTCACTCCAAATACACCCCCCACTTTCTCACTCTCACCACACAATTACTCTCCGATAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986011
ATGGCCTCCACCGCTGCATCACCGGCCTTCTGCGCCATCCCCAAGGCCTCCACCGCCGCCCGGGCCTCTCTCAACCCCCCCACCACCCGCTTCCTCGCCAAGACCCCTCTCCGCCGCCTGGCCTTCGCCGCCGCCGACCCACTCCTCGCCCACCACGTCGCCACCAAGCTGCGATCATTCTCCGCCAAGCCCGTCAGAGGTGTCGCCACCATGGCCAAGAGGAGCGTTGGCGACCTGTCCGCCGCCGAGCTCAAGGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765249.1
MASTAASPAFCAIPKASTAARASLNPPTTRFLAKTPLRRLAFAAADPLLAHHVATKLRSFSAKPVRGVATMAKRSVGDLSAAELKGKKVFVRADLNVPLDDNQNITDDTRIRAAIPTIKHLINNGAKVILSTHLGRPKGVTPKFSLAPLVPRLSELLGIQVVKADDCIGPEVEKLVSGLADGSVLLLENVRFYKEEEKNEPEFAKKLASLADLYVNDAFGTAHRAHASTEGVTKFLKPSVAGFLLQKELDYLDGAVKNPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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