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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001345`

染色体: Chr05 坐标: 11881977-11884803 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001345`
名称	SmilChr05G001345
描述	porphobilinogen deaminase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11881977 - 11884803 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986043`
GeneID	`130986043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986043`
原始查询	`LOC130986043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	porphobilinogen deaminase, chloroplastic
产物	porphobilinogen deaminase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G08280` (HEMC) hydroxymethylbilane synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830724] identity=76.8; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0168800` (PBD) - identity=76.8; qcov=0.829; evalue=7.46e-178; confidence=high
GO	GO:0004418 (hydroxymethylbilane synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006783 (heme biosynthetic process); GO:0018160 (peptidyl-pyrromethane cofactor linkage)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01379 (Porphobil_deam); PF03900 (Porphobil_deamC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057765297.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057765297.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765297.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765297.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11883681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr5:11884515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr5:11884614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B132,B33,C48,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765297.1

375 aa

188

375

Porphobil_deam

Porphobil_deamC

PF01379 Porphobil_deam 68-280 aa PF03900 Porphobil_deamC 293-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765297.1`	Pfam	`PF01379`	Porphobil_deam	Domain	68	280	1.5e-78	263.8	Porphobilinogen deaminase, dipyromethane cofactor binding domain
`XP_057765297.1`	Pfam	`PF03900`	Porphobil_deamC	Domain	293	365	1e-14	55.3	Porphobilinogen deaminase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909314.1
AGTATAGTGTAAAATCTTTTATCATCAGGTTAAGAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAGTGAACAAAACTCCAACGAGATTTCCTTTCAACGCTATCCATTTTCATATCTCCATTCCATCAGCAATGGAGATTGCCGCCGTAGCCTTACCAACTGTTAATCCAGCTCAATTTAGGCCTCTTTCAGCTAATTTCGCCGCCGGCTCAGTTTCAGCTCTCGGTTTCTCTCCCTCCACCAGTCGGAAATCTTCGCTCGCGCGAGCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986043
ATGGAGATTGCCGCCGTAGCCTTACCAACTGTTAATCCAGCTCAATTTAGGCCTCTTTCAGCTAATTTCGCCGCCGGCTCAGTTTCAGCTCTCGGTTTCTCTCCCTCCACCAGTCGGAAATCTTCGCTCGCGCGAGCCAGGACTTTGCTTATTAGGGCTTCCCTTGCTGTCGAGCAGCAGGCCGAGACTAAAGCTGCCGTGATCAGAATCGGAACTAGGGGGAGTCCACTGGCCCTCGCCCAAGCTTATGAAACTCGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765297.1
MEIAAVALPTVNPAQFRPLSANFAAGSVSALGFSPSTSRKSSLARARTLLIRASLAVEQQAETKAAVIRIGTRGSPLALAQAYETRDKLIGSHPQLAESGAIQIVVIKTTGDKILTQPLADIGGKGLFTKEIDEALINSDIDIAVHSMKDVPTYLPKNTMIPCNLPREDVRDAFICLTAASLAELPAGSTVGTASLRRKSQLLNRYPSLKVLENFRGNVQTRLKKLNEGVVQATLLALAGLKRLNMTENVTSILSIDDML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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