当前解析结果
SmilChr01G002718| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002718 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002718 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002718 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45457532 - 45460232 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986133 |
|---|---|
| GeneID | 130986133 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986133 |
| 原始查询 | LOC130986133 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Mitochondrial ATP synthase subunit G protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816487]; symbol=AT2G19680; hit=AT2G19680; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Mitochondrial ATP synthase subunit G protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816487]; symbol=AT2G19680; hit=AT2G19680; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G19680 (AT2G19680)Mitochondrial ATP synthase subunit G protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816487] identity=80.3; qcov=1; evalue=2.01e-74; confidence=high |
| Rice | Os01g0600000- identity=69.2; qcov=0.984; evalue=2.59e-61; confidence=high |
| GO | GO:0000276 (GO:0000276); GO:0015078 (proton transmembrane transporter activity); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis) |
| KEGG | smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF04718 (ATP-synt_G) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986133 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057765404.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057765404.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057765404.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057765404.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765404.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:45457815 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765404.1PF04718
ATP-synt_G 15-120 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765404.1 |
Pfam | PF04718 |
ATP-synt_G | Family | 15 | 120 | 1.2e-21 | 78.1 | Mitochondrial ATP synthase g subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。