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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001553`

染色体: Chr05 坐标: 14250771-14254864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001553`
名称	SmilChr05G001553
描述	protein HOMOLOG OF MAMMALIAN LYST-INTERACTING PROTEIN 5
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14250771 - 14254864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986242`
GeneID	`130986242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986242`
原始查询	`LOC130986242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HOMOLOG OF MAMMALIAN LYST-INTERACTING PROTEIN 5
产物	protein HOMOLOG OF MAMMALIAN LYST-INTERACTING PROTEIN 5
Arabidopsis	`AT4G26750` (EXT-like) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828782] identity=79.9; qcov=0.331; evalue=2.89e-87; confidence=low
Rice	`Os06g0308800` - identity=67.3; qcov=0.451; evalue=1.61e-95; confidence=medium
GO	GO:0005771 (multivesicular body); GO:0032511 (late endosome to vacuole transport via multivesicular body sorting pathway)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04652 (Vta1); PF18097 (Vta1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765574.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057765574.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057765574.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057765574.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057765574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14250935`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	77	A11,A13,A15,A2,A21,A22,A6,A8,B1,B100,B104,B107,B112,B115,B118,B128,B132,B134,B138,B139,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B3,B32,B33,B35,B42,B43,B45,B48,B52,B56,B59,B61,B64,B65,B68,B7,B71,B74,B78,B8,B80,B82,B85,B9,B91,B96,B97,C10,C11,C13,C14,C15,C21,C29,C34,C36,C38,C48,C49,C56,C57,C58,C6,C62,C63,C65,C69,D1,D10,D4,D7
`Chr5:14251023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14251114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14251300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:14251344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14251431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:14251432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:14251473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:14251662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B33,B49,B68,C48
`Chr5:14251755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:14251836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D9
`Chr5:14252657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A6,B14,B28,B50,B83,C30,C44,C74,C77,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765574.1

495 aa

248

495

Vta1

Vta1_C

PF04652 Vta1 12-148 aa PF18097 Vta1_C 452-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765574.1`	Pfam	`PF04652`	Vta1	Family	12	148	2.7e-45	154.6	Vta1 like
`XP_057765574.1`	Pfam	`PF18097`	Vta1_C	Domain	452	489	5.2e-09	36.3	Vta1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909591.1
TTTGATTCGCGACGTCGTATTTCCTGCAAGCATCTTTTCGTCCCCATTTTCCACCTTCTGCTACAACTGCCCATCTTTCCTCTGAGTCGAGCCTCGTTCATGGCGGCGGAAAATGAGCCGGCGAAGCTACTTCTTCCTTATCTTCAGCGGGCTGATGAGCTGCAGAAACACGAACACCTCGTTGCCTACTACTGTCGATTGTACGCGATGGAACGAGGGTTAAGGATTCCTCAGAGCGATCGCACTAAGATGACCAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986242
ATGGCGGCGGAAAATGAGCCGGCGAAGCTACTTCTTCCTTATCTTCAGCGGGCTGATGAGCTGCAGAAACACGAACACCTCGTTGCCTACTACTGTCGATTGTACGCGATGGAACGAGGGTTAAGGATTCCTCAGAGCGATCGCACTAAGATGACCAATTCCCTCCTTGTTTCCCTCATGAATCAGCTCGAAAAGGATAGAAAGTCGCTGAAGTTGGGGCCTGATGATTATCTACATGTTGAGGGATTTGCCTCGAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765574.1
MAAENEPAKLLLPYLQRADELQKHEHLVAYYCRLYAMERGLRIPQSDRTKMTNSLLVSLMNQLEKDRKSLKLGPDDYLHVEGFASNVFSKADKQDRAGRADLNTAKTFYAASIFFEILNQFGELQPDLEQKQKYAAWKAADIRKALKEGRKPIPGPPGGDTDLSVPSSTYNGANDLEPSRSDVADLGTRSDLARVDSAARTAPAPDSFPQAYDHDNLQHSTDFSQPPSNVMGSPASGIPPQSHHPTDNYSGVDPASRMAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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