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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001590`

染色体: Chr05 坐标: 14595858-14601167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001590`
名称	SmilChr05G001590
描述	uncharacterized SmilChr05G001590
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14595858 - 14601167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986271`
GeneID	`130986271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986271`
原始查询	`LOC130986271`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme, YBL036C type [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828793]; symbol=AT4G26860; hit=AT4G26860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme, YBL036C type [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828793]; symbol=AT4G26860; hit=AT4G26860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G26860` (AT4G26860) Putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme, YBL036C type [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828793] identity=75.6; qcov=1; evalue=7.18e-137; confidence=high
Rice	`Os05g0150000` - identity=74.7; qcov=0.946; evalue=3.1e-128; confidence=high
GO	GO:0005622 (intracellular anatomical structure); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF01168 (Ala_racemase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765610.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765610.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057765610.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057765610.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14596119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:14596161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:14597854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:14597876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B31,B57,B90,B92
`Chr5:14598739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765610.1

242 aa

121

242

Ala_racemase_N

PF01168 Ala_racemase_N 14-237 aa

XP_057765611.1

242 aa

121

242

Ala_racemase_N

PF01168 Ala_racemase_N 14-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765610.1`	Pfam	`PF01168`	Ala_racemase_N	Domain	14	237	1.1e-16	61.9	Alanine racemase, N-terminal domain
`XP_057765611.1`	Pfam	`PF01168`	Ala_racemase_N	Domain	14	237	1.1e-16	61.9	Alanine racemase, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909628.1
CTTGAGCTCGCAGAATCACTAAAAATAGATTAATTACGGATAAGTTGAGAAATTCCTACTGCCTTCCCTTTATCACCCCCCCCTCCCCATTCGGAGATAGTGGAGCAGGCATCCCGATACGATGGCGACTCCGGCCGTGGAAGGCGCAGCAGTGACGGCGCTACGGGCGGTGCTTCACCGTGTCCAAATCGCGGCGGAAAGGTCCGGCCGCCGCGCCAATGATGTGAGGGTCGTTGCGGTGAGCAAGACAAAGCCGCTGG...

XM_057909627.1
CTTGAGCTCGCAGAATCACTAAAAATAGATTAATTACGGATAAGTTGAGAAATTCCTACTGCCTTCCCTTTATCACCCCCCCCTCCCCATTCGGAGATAGTGGAGCAGGCATCCCGATACGATGGCGACTCCGGCCGTGGAAGGCGCAGCAGTGACGGCGCTACGGGCGGTGCTTCACCGTGTCCAAATCGCGGCGGAAAGGTCCGGCCGCCGCGCCAATGATGTGAGGGTCGTTGCGGTGAGCAAGACAAAGCCGCTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986271
ATGGCGACTCCGGCCGTGGAAGGCGCAGCAGTGACGGCGCTACGGGCGGTGCTTCACCGTGTCCAAATCGCGGCGGAAAGGTCCGGCCGCCGCGCCAATGATGTGAGGGTCGTTGCGGTGAGCAAGACAAAGCCGCTGGCCCTCATCGACCAACTCTACGGCGTCGGCCACAGGTGCTTCGGCGAAAACTACGTCCAGGAAATTATCGAAAAAGCCCCTCAGCTGCCTGAAGACATTGAGTGGCATTTCGTCGGCCATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765610.1
MATPAVEGAAVTALRAVLHRVQIAAERSGRRANDVRVVAVSKTKPLALIDQLYGVGHRCFGENYVQEIIEKAPQLPEDIEWHFVGHLQSNKAKALLTAVPHLAMVQGVDNEKVANNLDRVVSSIGRKPLKVLVQVNTSGEVSKSGLNPSECVEFVKHVKLGCPNLVFSGLMTIGMPDYTSTPENFKTLLNCRAEVCKALGIIESQCELSMGMSGDFEQAIEMGSTSVRIGTTIFGPRDYSKK

XP_057765611.1
MATPAVEGAAVTALRAVLHRVQIAAERSGRRANDVRVVAVSKTKPLALIDQLYGVGHRCFGENYVQEIIEKAPQLPEDIEWHFVGHLQSNKAKALLTAVPHLAMVQGVDNEKVANNLDRVVSSIGRKPLKVLVQVNTSGEVSKSGLNPSECVEFVKHVKLGCPNLVFSGLMTIGMPDYTSTPENFKTLLNCRAEVCKALGIIESQCELSMGMSGDFEQAIEMGSTSVRIGTTIFGPRDYSKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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