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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G002739

染色体: Chr01 坐标: 45707023-45710536 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G002739
名称SmilChr01G002739
描述serine acetyltransferase 5-like
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向45707023 - 45710536 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130986286
GeneID130986286
locus_tag-
NCBI NameLOC130986286
原始查询LOC130986286

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述serine acetyltransferase 5-like
产物serine acetyltransferase 5-like
ArabidopsisAT5G56760 (SERAT1;1)
serine acetyltransferase 1;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835778]
identity=89.5; qcov=0.921; evalue=4.6e-173; confidence=high
RiceOs05g0533500
-
identity=76.6; qcov=0.969; evalue=1.58e-151; confidence=high
GOGO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0006535 (GO:0006535); GO:0009001 (L-serine O-acetyltransferase activity)
KEGGsmil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00543 (Exopolysaccharide biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF00132 (Hexapep); PF06426 (SATase_N); PF14602 (Hexapep_2)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130986286

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057765638.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.60000 XP_057765638.1
3 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057765638.1
4 Mitochondrion 线粒体 0.20000 XP_057765638.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057765638.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765638.1
291 aa
N
1
146
291
SATase_N
Hexapep_2
Hexapep
Hexapep_2
C
PF06426 SATase_N 25-129 aa PF14602 Hexapep_2 176-192 aa PF00132 Hexapep 209-242 aa PF14602 Hexapep_2 211-242 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057765638.1 Pfam PF06426 SATase_N Domain 25 129 9.7e-34 116.6 Serine acetyltransferase, N-terminal
XP_057765638.1 Pfam PF14602 Hexapep_2 Repeat 176 192 2.8e-07 30.9 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase
XP_057765638.1 Pfam PF00132 Hexapep Repeat 209 242 1.1e-14 54.1 Bacterial transferase hexapeptide (six repeats)
XP_057765638.1 Pfam PF14602 Hexapep_2 Repeat 211 242 2.8e-07 30.9 Hexapeptide repeat of succinyl-transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057909655.1
TGTGAGAATCCTTAAGAAAAATGACGACCAATCCTTTTCTCTTTAACCGATTAATTTCAATATCCAATCACAATACCACATTATTTCCCGACATTTTCAACGGCGAACCCTAAAACACAACCCCAAAACGACGCCGTGGCAATGCCTACTGGGGAAATCTGCCACCCCTCACCGCCGCCGATGCCTCCGGGTTCGGAGGGAGAGGAGGAATGGCTGTGGGGACATATCAAAGCCGAGGCTCGTATAGACGCCGAAGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130986286
ATGCCTACTGGGGAAATCTGCCACCCCTCACCGCCGCCGATGCCTCCGGGTTCGGAGGGAGAGGAGGAATGGCTGTGGGGACATATCAAAGCCGAGGCTCGTATAGACGCCGAAGCCGAGCCGGCTCTGGCCAGCTATCTCTACTCCACAATCCTCTCTCACTCCTCCTTGGAGCGCTCTCTCTCCTTCCACTTGGGCAACAAGCTCTGCTCCTCTACTCTGCTCTCCACGCTTCTCTATGACCTCTTCCTCAACATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057765638.1
MPTGEICHPSPPPMPPGSEGEEEWLWGHIKAEARIDAEAEPALASYLYSTILSHSSLERSLSFHLGNKLCSSTLLSTLLYDLFLNIFSTDSSLRSATVADLRAARFRDPACISFSHCLLNYKGFLACQAHRVAHKLWTQSRKPLALALQARISDVFAVDIHPGAKVGKGILFDHATGVVVGETAVIGNNVSILHHVTLGGTGKSSGDRHPKIGDGVLIGAGATILGNVKIGEGAKIGAGSVVLIDVPPRTTAVGNPARLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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