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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002749`

染色体: Chr01 坐标: 45805944-45807707 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002749`
名称	SmilChr01G002749
描述	uncharacterized SmilChr01G002749
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45805944 - 45807707 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986415`
GeneID	`130986415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986415`
原始查询	`LOC130986415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829089]; symbol=AT4G29680; hit=AT4G29680; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829089]; symbol=AT4G29680; hit=AT4G29680; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G29680` (AT4G29680) Alkaline-phosphatase-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829089] identity=66.9; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0196600` - identity=70.5; qcov=0.799; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01663 (Phosphodiest)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057765807.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057765807.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765807.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765807.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45806367`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B132,B72,C33,C46,C47,C65
`Chr1:45806472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:45807500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765807.1

492 aa

246

492

Phosphodiest

PF01663 Phosphodiest 105-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765807.1`	Pfam	`PF01663`	Phosphodiest	Family	105	431	2.6e-109	366.7	Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909824.1
AAGTCGTAGTTGATGTCACCACCTACCATTCTCTTCTTCCTCTACTCTCTTCTTGACTTCTTCAACTATCAACCTTCACTCCATTTCAACATCACCATACAAACAATCGCGCAGCTTTCTCCAATTCTACACCAATGGCTTCCGATCCAGAATCCACTCTAACCACCTCACTTCCAATCTCACCTAACGAACTCGAAGACGATCTCCGCGCTTCCTCCTCCTCCTCCGCCCTCCTATCCACCGCCGCCCACCCCCACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986415
ATGGCTTCCGATCCAGAATCCACTCTAACCACCTCACTTCCAATCTCACCTAACGAACTCGAAGACGATCTCCGCGCTTCCTCCTCCTCCTCCGCCCTCCTATCCACCGCCGCCCACCCCCACTCCCCCAGGAAAACCGCCGCCGCCACCCTCGTTTTCATCTCCCTCGTCATGTCCACCGCCGTCGCACTCTCCGCCGCCGCCGCATTCTCCTTCCTCTTCTTCTCCTCCGCATCTCCCCCCGCCCAAAACCCCAGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765807.1
MASDPESTLTTSLPISPNELEDDLRASSSSSALLSTAAHPHSPRKTAAATLVFISLVMSTAVALSAAAAFSFLFFSSASPPAQNPSLGSTAALSRPLSKLKHPVVLIISSDGFRFGYQYKTDLPNISRLIHNGTEAERGLIPVFPTLTFPNHYSIVTGLYPAYHGIINNYFTDPVNGHKFNMGSHEPEWWLGEPLWETVANHGLKASTYFWPGSEVHKGSWDCPKFYCMPYNESVPFEERVDTVLNYFDLPSDDIPSFMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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