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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001753`

染色体: Chr05 坐标: 17067502-17070050 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001753`
名称	SmilChr05G001753
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17067502 - 17070050 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986418`
GeneID	`130986418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986418`
原始查询	`LOC130986418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1
产物	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1
Arabidopsis	`AT1G25390` (AT1G25390) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839125] identity=49.4; qcov=0.986; evalue=1.02e-160; confidence=high
Rice	`Os01g0136400` (OsWAK1) - identity=56; qcov=0.726; evalue=1.21e-141; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057765809.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765809.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765809.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765809.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057765809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17067745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B9,C32,C40
`Chr5:17068710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr5:17068735`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr5:17068735`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr5:17068772`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A22,B110,B112,B124,B16,B30,B6,B66,B76,C27,C63,C64,C66,C9,D2
`Chr5:17069527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:17069557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:17069690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765809.1

573 aa

286

573

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 299-565 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 299-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765809.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	299	565	2.2e-46	159.1	Protein kinase domain
`XP_057765809.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	299	567	2e-47	162.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909826.1
TTCTCTCGTCAGCTATAGAGAGAGAGAATCGAAAAATTGAAAAGTCTAGACTGGGAGTAACCCATATGAGACGTTCACGTAGGTCCAACATTTCTGGGCAATTACCAGTTGAAATGCTTTTCCTAGTCTTCTCTGGAGTCAACTCCAGCAACAGCTCAAAGCAATTCATCAACATGTGCTGTGCAAGCACAGATACACAGCATGAAGCTTCCCAAGTATCTGATTCTCTCTCTACTTCACTGTCTGATCATCACCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986418
ATGAAGCTTCCCAAGTATCTGATTCTCTCTCTACTTCACTGTCTGATCATCACCTCAACCCTTTCCAAATGCCCACAATCCTACCCTTGCCGAAACCTTACCTTGAAATTCCCATTCACCGACATTCGGAACCCCGAATGCGGATTGTTCATGGTTGATGGCTGCAATTCTACACATGGACTTCCCAGAATTCAACTAGAAGCTCAAGGCCTTCGTTATGATCTGCTTCAGCTTTCGGAGAATAACATGTCTGTTCGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765809.1
MKLPKYLILSLLHCLIITSTLSKCPQSYPCRNLTLKFPFTDIRNPECGLFMVDGCNSTHGLPRIQLEAQGLRYDLLQLSENNMSVRYSQLQKLFKEGTYFLLRLPKYPFSSLTIASPHLNLLSCNNPHFGGNPYNCSQIPLNLFCVNLTAPKETRDSSECSMIQVPINTEPNQCSKIHLNQLNPEFTLEFNVSHDCYQCHRRGGQCFRNWINDFYCKEGSSRLVLILAISGGGLLFILCLLISYMIWLLKKRVGTGYIRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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