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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001862`

染色体: Chr05 坐标: 18653273-18658004 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001862`
名称	SmilChr05G001862
描述	polyadenylate-binding protein RBP47-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18653273 - 18658004 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986530`
GeneID	`130986530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986530`
原始查询	`LOC130986530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein RBP47-like
产物	polyadenylate-binding protein RBP47-like
Arabidopsis	`AT1G47490` (RBP47C) RNA-binding protein 47C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841157] identity=63.8; qcov=0.883; evalue=4.12e-155; confidence=high
Rice	`Os09g0462700` - identity=71.5; qcov=0.726; evalue=7.62e-151; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057765944.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057765944.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057765944.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057765944.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057765944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18653698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:18653794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C52,C69
`Chr5:18655657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C24
`Chr5:18655801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C24
`Chr5:18656877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:18656879`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C76
`Chr5:18656879`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C76
`Chr5:18657286`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B126,B135,B40,B41,B42,B43,B6,C12,C16,C30,C4,C67,C74
`Chr5:18657304`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A7,B100,B109,B114,B127,B14,B34,B37,C41,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765944.1

401 aa

200

401

RRM_1

RRM_5

RRM_1

PF00076 RRM_1 104-163 aa PF00076 RRM_1 197-266 aa PF13893 RRM_5 297-380 aa PF00076 RRM_1 310-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765944.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	104	163	8.8e-55	183.2	RNA recognition motif
`XP_057765944.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	197	266	8.8e-55	183.2	RNA recognition motif
`XP_057765944.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	297	380	3.4e-06	27.5	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057765944.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	310	373	8.8e-55	183.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909961.1
GAAACATACATTGGCGGCCGAGTAAGACCGAATCCATGTTATCGTACGCAAACAGACGGCCAAGATCTTTCCGATCTAACGGCTGTGAGAACTTGCGCGTCATCTCAGGGCTTCCCATGAAAACCTCAAATCCTCTTGTTCAGCCTCCACACACGCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTTCACAAAAACTCAGATTCACCTATACGTACACCTCTCTCTATATCTATATCTATATCTCTCTCATAATATTATCAAAATTTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986530
ATGCAAACCAGTAACGGTTCCGAATCTCAACAGAGTAGTTCCAAGGAGAGCAATAACGAAAGCAGCAATGGCGGCAGCAAGGCGGTGCAGCCGCCGCCGCAGGTGGTCGCGGCGGTGCCTGGTCAGCAGTGGGTGGCGATGCAGTACCCCGCCGCGGCGATGGTAATGCAGCATGGGATGATTCCGGCGCCTCATTACGCGCCGCACTACATGCCGTACCACCTCCACCATCACCCGCCCCTGCCCCCGCCGCAGCAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765944.1
MQTSNGSESQQSSSKESNNESSNGGSKAVQPPPQVVAAVPGQQWVAMQYPAAAMVMQHGMIPAPHYAPHYMPYHLHHHPPLPPPQQSGGGSSNGGGSNGENRTIWVGDLHNWMDEDYLRSCFSQTGEVSSIKVIRNKQTGFSEGYGFVEFFTHAAAEKALQTYSVLAMPNTDQPFRLNWAAFSMGDKRSNNGSDLSIFVGDLAADVTDTLLHDTFASKYPSVKAAKVVIDANTGRSKGYGFVRFGDDNERTQAMTEMNGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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