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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001900`

染色体: Chr05 坐标: 19277576-19287440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001900`
名称	SmilChr05G001900
描述	structural maintenance of chromosomes protein 2-1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19277576 - 19287440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986562`
GeneID	`130986562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986562`
原始查询	`LOC130986562`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes protein 2-1-like
产物	structural maintenance of chromosomes protein 2-1-like
Arabidopsis	`AT5G62410` (SMC2) structural maintenance of chromosomes 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836362] identity=70.8; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0904400` (SMC2) - identity=70.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005694 (chromosome); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051276 (chromosome organization)
KEGG	-
Pfam	PF02463 (SMC_N); PF06470 (SMC_hinge)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765986.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057765986.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057765986.1`
4	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057765986.1`
5	PML body	PML body	0.20000	`XP_057765986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19277931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:19278427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C56,C59,C65
`Chr5:19278606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:19278642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:19278825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:19278951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B33,B68,C48,C9
`Chr5:19279046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:19279063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B31,B54,C42,C47
`Chr5:19279262`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr5:19279262`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr5:19279270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C22,D9
`Chr5:19279291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765986.1

1176 aa

588

1176

SMC_N

SMC_hinge

SMC_N

PF02463 SMC_N 2-481 aa PF06470 SMC_hinge 519-638 aa PF02463 SMC_N 856-1161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765986.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	2	481	3.7e-62	210.3	RecF/RecN/SMC N terminal domain
`XP_057765986.1`	Pfam	`PF06470`	SMC_hinge	Domain	519	638	7.3e-24	85.1	SMC proteins Flexible Hinge Domain
`XP_057765986.1`	Pfam	`PF02463`	SMC_N	Domain	856	1161	3.7e-62	210.3	RecF/RecN/SMC N terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910003.1
AGTTTGGGAACGCAGATAAATTCGGCATTTCTAGTGTAGATTTAAAATTTGAAGAAGGAAATCTGAAGCCCGCTTGCCTTGCTCGTTCCAAATTCCCCCTAATCTTCCAGAAATCATTCCCATCCATCTGTAATTCCAGAGAGGAAATGCACATTAAGGAAATCTGTCTTGAGGGGTTTAAGTCCTATGCAACGAGAACCGTGGTTCCGGGTTTCGACCCGTATTTCAACGCTATAACAGGCCTCAACGGCTCCGGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986562
ATGCACATTAAGGAAATCTGTCTTGAGGGGTTTAAGTCCTATGCAACGAGAACCGTGGTTCCGGGTTTCGACCCGTATTTCAACGCTATAACAGGCCTCAACGGCTCCGGCAAATCCAACATCCTCGACTCAATATGCTTTGTGCTGGGCATCACCAATTTGCAACAGGTTAGGGCTGCTAATTTGCAGGAGCTGGTGTACAAGCAGGGCCAAGCTGGAATCACCAAGGCCACTGTATCCATTGTTTTTGACAACTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765986.1
MHIKEICLEGFKSYATRTVVPGFDPYFNAITGLNGSGKSNILDSICFVLGITNLQQVRAANLQELVYKQGQAGITKATVSIVFDNSDRSRSPLGYEDSPEITVTRQIVVGGRNKYLINGHLAQPSRVQNLFHSVQLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPETLSMLEEAAGTRMYETKKEAALKTLEKKQSKVDEIDKLLDQEILPALQKLRKERMQYMQWANGNAELDRLKRYCIAYEYVQAEKNRDDTIQGVQAIRNKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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