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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001955`

染色体: Chr05 坐标: 19992100-19994899 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001955`
名称	SmilChr05G001955
描述	cysteine proteinase 15A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19992100 - 19994899 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986611`
GeneID	`130986611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986611`
原始查询	`LOC130986611`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase 15A-like
产物	cysteine proteinase 15A-like
Arabidopsis	`AT4G16190` (AT4G16190) Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827311] identity=69.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0469600` - identity=67.9; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057766049.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766049.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766049.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766049.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766049.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19992248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,C45,C61,C85
`Chr5:19992329`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr5:19992329`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33
`Chr5:19992338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B56,B96
`Chr5:19992364`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992364`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992367`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992367`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992370`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992370`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B36,B97
`Chr5:19992380`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr5:19992380`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766049.1

372 aa

186

372

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 56-112 aa PF00112 Peptidase_C1 141-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766049.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	56	112	3.6e-16	59.9	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057766049.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	141	364	1.8e-73	248.0	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910066.1
CACCAATGGGACACATTCCCCATTACTATAAATAAGGTTTCCCCACCCTACTTCTCCACTGCGACAACCATGGCTCCTTTGACTTTCTCTCTCCTCCTCACTCTCTCTCTCTTATCCTCCGCGCTCGCCTCCACGCAACCCTTCCTGGCCTCCGTCGCCGACGATCCTCTCATCCGCCAGGTCGTATCTGAAGGTGCGGAGGCGGTGGACCAGCTCCTGCACGCCGACCACCACTTCACCCTCTTCAAGTCCAAGTACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986611
ATGGCTCCTTTGACTTTCTCTCTCCTCCTCACTCTCTCTCTCTTATCCTCCGCGCTCGCCTCCACGCAACCCTTCCTGGCCTCCGTCGCCGACGATCCTCTCATCCGCCAGGTCGTATCTGAAGGTGCGGAGGCGGTGGACCAGCTCCTGCACGCCGACCACCACTTCACCCTCTTCAAGTCCAAGTACAGCAAGGCCTACGCCACCCAGGAGGAGCACGACTACCGATTCTCTGTCTTCAAGGCTAACCTGCGCCGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766049.1
MAPLTFSLLLTLSLLSSALASTQPFLASVADDPLIRQVVSEGAEAVDQLLHADHHFTLFKSKYSKAYATQEEHDYRFSVFKANLRRAKRHQLVDPTAVHGVTKFSDLTPEEFERTYLGLHKQRLKLPADAHEAPKLPTNDLPADFDWREHGAVGAVKDQGSCGSCWSFSTIGALEGAHYLATGELLSLSEQQLVDCDHECDPAERNSCDSGCNGGLMNNAFEYILKAGGVQTEKDYPYTGVDGQCKFNQNGIVAGVSNFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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