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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001996`

染色体: Chr05 坐标: 20684389-20687840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001996`
名称	SmilChr05G001996
描述	AP-2 complex subunit sigma
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20684389 - 20687840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986645`
GeneID	`130986645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986645`
原始查询	`LOC130986645`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-2 complex subunit sigma
产物	AP-2 complex subunit sigma
Arabidopsis	`AT1G47830` (AT1G47830) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841199] identity=96.5; qcov=0.993; evalue=1.18e-97; confidence=high
Rice	`Os12g0207300` - identity=95.8; qcov=1; evalue=1.6e-98; confidence=high
GO	GO:0015031 (protein transport); GO:0030122 (AP-2 adaptor complex); GO:0035615 (clathrin-cargo adaptor activity); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057766091.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057766091.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057766091.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057766091.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057766091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20684918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B37,C77
`Chr5:20684930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr5:20684933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:20684940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr5:20684949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B103,B12
`Chr5:20684949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B12
`Chr5:20685005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:20685006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C30,C41,C81
`Chr5:20685166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:20685651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,B45,C30
`Chr5:20685731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:20685787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766091.1

142 aa

142

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 1-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766091.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	141	1.1e-53	181.8	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910108.1
AATATATCCTCAATAATTTTTTTCTTTCTTTCTATTTTATTATAAATTATTCATTTTTTAATATTTGTGCCCAAGTCTTGTGACCTATTGAATTGGAACACCGAAAGTATATTTTATAAAGTCTTAAAATATTTTACAAGTTATTAGAGCTTATAAACTCTTTAAAATAAACTCAGCCAAACACTCTCTTTAATTTCAACAGAGTTAGTTTTTTTTTTTTCCCTACATTTTTCAACATTAATAAAATCAAAAGTGGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986645
ATGATCCGGTTCATACTATTGCAGAACAGGCAAGGGAAAACTCGATTGGCCAAATACTACATTCCTCTCGAGGAGTCCGAGAAACATAAGGTTGAGTACGAGGTTCATCGTTTGGTTGTTAATAGGGATCCCAAATTCACCAATTTCGTGGAGTTCCGAACCCACAAGGTCATCTACAGGCGATATGCTGGTTTATTTTTCTCGTTGTGTGTAGACATTACAGACAATGAATTGGCGTATTTGGAGAGCATTCACTTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766091.1
MIRFILLQNRQGKTRLAKYYIPLEESEKHKVEYEVHRLVVNRDPKFTNFVEFRTHKVIYRRYAGLFFSLCVDITDNELAYLESIHLFVEILDHFFSNVCELDLVFNFHKVYLILDEFILAGELQETSKKAIIERMGELEKLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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