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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002025`

染色体: Chr05 坐标: 21017562-21020290 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002025`
名称	SmilChr05G002025
描述	uncharacterized SmilChr05G002025
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21017562 - 21020290 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986666`
GeneID	`130986666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986666`
原始查询	`LOC130986666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class X-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834729]; symbol=AT5G46850; hit=AT5G46850; species=arabidopsis; confidence=high
产物	phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class X-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834729]; symbol=AT5G46850; hit=AT5G46850; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46850` (AT5G46850) phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class X-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834729] identity=46.1; qcov=0.932; evalue=1.41e-63; confidence=high
Rice	`Os12g0596900` - identity=37.4; qcov=0.91; evalue=7.27e-44; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08320 (PIG-X)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766115.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057766115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766115.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766115.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21018215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C24,C32,C68
`Chr5:21018227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr5:21018258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C31
`Chr5:21019242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B73,C31
`Chr5:21019339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766115.1

279 aa

140

279

PIG-X

PF08320 PIG-X 87-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766115.1`	Pfam	`PF08320`	PIG-X	Domain	87	272	1.5e-25	91.1	PIG-X / PBN1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910132.1
CGGTTGGAAAAAGAGGTAGAAGAAAAGGAAAAAATAATGCACAAACAAACATATGCTCGTATCGCCCCCGATGTAAAGAAAGCTCAATCACTATTCGCAACTCACAAAATCAGAACAAACGGCTTCTGCAGCAGTTTCGCCTCACCCTTGCGTCCTGCTCTTCTTGTTGTTTTTGCTCAGATTTGGAGATGGAAACTCATTCAATCCAGTGTCTTGCAGTGATATTTCTCATAAGCATCAAATCCTTCGTGCTTGCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986666
ATGGAAACTCATTCAATCCAGTGTCTTGCAGTGATATTTCTCATAAGCATCAAATCCTTCGTGCTTGCTTCGACTTATGGACAAACATGTTATGTCGATGAATACATCGCAGAAAGCTATTTCAAGAAATACGATAGTTTTATAGAACGAGAATTTGACAATTTCATAGCAAATAAAATCCCACTAGGCTCGTGCAAAGTGCTTGAAGATAAAAATCAAGTTTTGGTGAAGAGTCTAAGTCGAAATGTCACTGGTGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766115.1
METHSIQCLAVIFLISIKSFVLASTYGQTCYVDEYIAESYFKKYDSFIEREFDNFIANKIPLGSCKVLEDKNQVLVKSLSRNVTGEGSHRWLSSSIRLKLKHKLTAHSCVVVIIERLPSGVFTDPFELQHFVQRSVFTDAAVFGDTNLELPSFRSNQTVVEIHMSIDSRVVSRDEHESEVNLKVPLHARYQPLGLGFSRVEFGAPDIFTCCRSTERDVPKRLCQSIPTNLITDKKASPLIWEIPCGNKEHAAVVSAVTFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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