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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002095`

染色体: Chr05 坐标: 21902671-21910797 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002095`
名称	SmilChr05G002095
描述	probable acyl-activating enzyme 16, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21902671 - 21910797 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986723`
GeneID	`130986723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986723`
原始查询	`LOC130986723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable acyl-activating enzyme 16, chloroplastic
产物	probable acyl-activating enzyme 16%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G23790` (AAE16) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821961] identity=69.7; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0845500` (OSJNBa0032G11.28) - identity=68.5; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008922 (long-chain fatty acid [acyl-carrier-protein] ligase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0030497 (fatty acid elongation)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF23562 (AMP-binding_C_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766199.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057766199.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057766199.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766199.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766199.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21906845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:21907003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:21909160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B57,C24,C29,C46
`Chr5:21909184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766199.1

415 aa

208

415

AMP-binding

AMP-binding_C_3

PF00501 AMP-binding 1-233 aa PF23562 AMP-binding_C_3 281-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766199.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	1	233	3.4e-28	99.3	AMP-binding enzyme
`XP_057766199.1`	Pfam	`PF23562`	AMP-binding_C_3	Domain	281	352	1.5e-14	55.2	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910216.1
ATTAAAAACTTATGGGACATTGTGCCAGCTGTTCCTGGGGATAGATTTCTGAGCATGCTGCCGCCTTGGCATGCATATGAACGAGCTTGTGAGTATTTCATATTTACTCTTGGAATTGAGCACGTATATACTACAGTCAAGAACCTAAGGGATGATTTGCGCCGATACCAACCTCATTATGTTATTTCTGTTCCCTTGGTATATGAAACACTTTACAGTGCGATCCAGAAGCAGATCAAAACTAGTTCAGCTGTTCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986723
ATGCTGCCGCCTTGGCATGCATATGAACGAGCTTGTGAGTATTTCATATTTACTCTTGGAATTGAGCACGTATATACTACAGTCAAGAACCTAAGGGATGATTTGCGCCGATACCAACCTCATTATGTTATTTCTGTTCCCTTGGTATATGAAACACTTTACAGTGCGATCCAGAAGCAGATCAAAACTAGTTCAGCTGTTCAACTTGTTGCTCTTTTATTCTTAAAGATCAGTTTCACATACATGGAGGCAAGAAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766199.1
MLPPWHAYERACEYFIFTLGIEHVYTTVKNLRDDLRRYQPHYVISVPLVYETLYSAIQKQIKTSSAVRXLVALLFLKISFTYMEARRIYEGKCLTRNLEQPSHISAVFDWLWARIIVLILWPLHILANKIVYSKIQSAVGISKAGISGGGSLPPHVDRFFEAIGVKVQNGYGLTESSPVVAARRLNCNVLGSIGHPLKHTEIEVFDPETDVVLPYGSKGIVKVRGPQVMKGYYKNPSATKKAIDEDGWLNTGDIGWICPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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