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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002752`

染色体: Chr05 坐标: 31786027-31791969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002752`
名称	SmilChr05G002752
描述	mitochondrial ATP-independent inner membrane protease subunit 1a
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31786027 - 31791969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986840`
GeneID	`130986840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986840`
原始查询	`LOC130986840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial ATP-independent inner membrane protease subunit 1a
产物	mitochondrial ATP-independent inner membrane protease subunit 1a
Arabidopsis	`AT1G53530` (AT1G53530) Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841788] identity=61.5; qcov=0.942; evalue=3.64e-70; confidence=high
Rice	`Os11g0620000` (OsSigP7) - identity=59.6; qcov=0.912; evalue=4.28e-70; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0006627 (GO:0006627); GO:0016020 (membrane); GO:0042720 (mitochondrial inner membrane peptidase complex)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10502 (Peptidase_S26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766346.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057766346.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057766347.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766346.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31790237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:31790241`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A21,A9,B104,B119,B123,B134,B21,B87,C3
`Chr5:31791835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766346.1

214 aa

107

214

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 27-108 aa PF10502 Peptidase_S26 120-159 aa

XP_057766347.1

171 aa

171

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 27-108 aa PF10502 Peptidase_S26 120-161 aa

XP_057766348.1

171 aa

171

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 27-108 aa PF10502 Peptidase_S26 120-161 aa

XP_057766349.1

171 aa

171

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 27-108 aa PF10502 Peptidase_S26 120-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766346.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	27	108	1e-23	84.9	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766346.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	120	159	1e-23	84.9	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766347.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	27	108	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766347.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	120	161	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766348.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	27	108	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766348.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	120	161	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766349.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	27	108	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26
`XP_057766349.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	120	161	7e-25	88.6	Signal peptidase, peptidase S26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089430.1
ACTCCACCCGCCTCCATGCCGTATATATCCCATCGTGGGGGCCATCAGTGGCAGCACATTTGAGGCAATGAGAGCTCCAAAACTGCTGCACCAATATGCTCTACAATGGAAGTCAGCAGCTAAGGAAGTGTTGAGCCACACCGTTCTCTTCGCTCAATTTATTTCCCTTTTGCACCTCACCGATAGCTACATTTGCTCTCCAACCCTAGTTTACGGCCCTAGCATGCTGCCGACATTGAATTTCACGGGCGACGTTTTGC...

XM_057910364.1
GTCTCACTTTACTCCACCCGCCTCCATGCCGTATATATCCCATCGTGGGGGCCATCAGTGGCAGCACATTTGAGGCAATGAGAGCTCCAAAACTGCTGCACCAATATGCTCTACAATGGAAGTCAGCAGCTAAGGAAGTGTTGAGCCACACCGTTCTCTTCGCTCAATTTATTTCCCTTTTGCACCTCACCGATAGCTACATTTGCTCTCCAACCCTAGTTTACGGCCCTAGCATGCTGCCGACATTGAATTTCACGGGC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986840
ATGAGAGCTCCAAAACTGCTGCACCAATATGCTCTACAATGGAAGTCAGCAGCTAAGGAAGTGTTGAGCCACACCGTTCTCTTCGCTCAATTTATTTCCCTTTTGCACCTCACCGATAGCTACATTTGCTCTCCAACCCTAGTTTACGGCCCTAGCATGCTGCCGACATTGAATTTCACGGGCGACGTTTTGCTGGTTGATAAGCTGTCTCCCTTGCTGGGGAAGGTCGGCACTGGTGACGTCGTTCTGGTACGATCACC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766346.1
MRAPKLLHQYALQWKSAAKEVLSHTVLFAQFISLLHLTDSYICSPTLVYGPSMLPTLNFTGDVLLVDKLSPLLGKVGTGDVVLVRSPENPRKNITKRIVGVEGDTVTFLVDPGRSDRSNSVLVPKGHVWIQGDNIYASNDSRHLGPVPYGLVCGKVFCRVSLAAMFLINYLYNLNCLIFSVFLCTAWKLHACLRYSFNQYPALETVCLLLPSPL

XP_057766347.1
MRAPKLLHQYALQWKSAAKEVLSHTVLFAQFISLLHLTDSYICSPTLVYGPSMLPTLNFTGDVLLVDKLSPLLGKVGTGDVVLVRSPENPRKNITKRIVGVEGDTVTFLVDPGRSDRSNSVLVPKGHVWIQGDNIYASNDSRHLGPVPYGLVCGKVFCRVWPPQEFGRLGQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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