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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002825`

染色体: Chr05 坐标: 33518526-33524613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002825`
名称	SmilChr05G002825
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	33518526 - 33524613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986903`
GeneID	`130986903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986903`
原始查询	`LOC130986903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase
产物	phosphoenolpyruvate carboxylase
Arabidopsis	`AT3G14940` (PPC3) phosphoenolpyruvate carboxylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820723] identity=87.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0366000` (Osppc) - identity=86.8; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0008964 (phosphoenolpyruvate carboxylase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0015977 (carbon fixation); GO:0048046 (apoplast); GO:0048366 (leaf development)
KEGG	smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00311 (PEPcase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766427.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766427.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057766427.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766427.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:33522543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:33523283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B38,B39
`Chr5:33523283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:33523873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B122,B140,C71
`Chr5:33524090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:33524150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:33524215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766427.1

964 aa

482

964

PEPcase

PF00311 PEPcase 34-964 aa

XP_057766428.1

964 aa

482

964

PEPcase

PF00311 PEPcase 34-964 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766427.1`	Pfam	`PF00311`	PEPcase	Family	34	964	0	1131.4	Phosphoenolpyruvate carboxylase
`XP_057766428.1`	Pfam	`PF00311`	PEPcase	Family	34	964	0	1131.4	Phosphoenolpyruvate carboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910444.1
AAAATGTTGGGAACGAAGTTTGCTCCTCGTCATTTGTCTATATATACAACTCTTCGGTACTGTCCTAAAATCACGAAACTCTCCCTTTCTCTCTCTTACTTTCCGATCCCCTTTTTTCTCAAGAATCTACTCTCCCAGCTTCAGAGTTGAGAGTTTGATCGGCCGCGATGGCTACAAGAAATTTGGAGAAGATGGCATCAATTGATGCCCAACTGCGGCTTTTGGTTCCTGGAAAAGTGTCTGAAGATGATAAACTTGTT...

XM_057910445.1
ACTCTCCCTTTCTCTCTCTTACTTTCCGATCCCCTTTTTTCTCAAGAATCTACTCTCCCAGCTTCAGGTACACCATCATGGAGTCTTAGTCAGCTCCCTTTCACTTTCCAGTATTAAGAGGAACACAAAAACCTGCTATCATATTCAAAAATAAGTTGAGAGTTTGATCGGCCGCGATGGCTACAAGAAATTTGGAGAAGATGGCATCAATTGATGCCCAACTGCGGCTTTTGGTTCCTGGAAAAGTGTCTGAAGATGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986903
ATGGCTACAAGAAATTTGGAGAAGATGGCATCAATTGATGCCCAACTGCGGCTTTTGGTTCCTGGAAAAGTGTCTGAAGATGATAAACTTGTTGAGTATGACGCCCTGCTTTTGGATCGGTTTCTCGATATTCTTCAGGATTTGCATGGAGAGGATCTCAAGGAAACGGTGCAAGAATGCTATGAGCTTTCAGCAGAGTACGAGAACAAACGTGATCCTAAGAAGCTGGAAGAGCTTGGAAATGTGTTGACAAGTTTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766427.1
MATRNLEKMASIDAQLRLLVPGKVSEDDKLVEYDALLLDRFLDILQDLHGEDLKETVQECYELSAEYENKRDPKKLEELGNVLTSLDPGDSIVVAKAFSHMLSLANLAEEVQIAYRRRNKKKKGDYTDENSATTESDIEETLKRLVVDLKKSPQEVFDALKNQTVDLVFTAHPTQSVRRSLLQKHGRIRNCLAQLYAKDITPDDKQELDEALQREIQAAFRTDEIRRTPPTPQDEMRAGMSYFHETIWKGVPKFLRRVDT...

XP_057766428.1
MATRNLEKMASIDAQLRLLVPGKVSEDDKLVEYDALLLDRFLDILQDLHGEDLKETVQECYELSAEYENKRDPKKLEELGNVLTSLDPGDSIVVAKAFSHMLSLANLAEEVQIAYRRRNKKKKGDYTDENSATTESDIEETLKRLVVDLKKSPQEVFDALKNQTVDLVFTAHPTQSVRRSLLQKHGRIRNCLAQLYAKDITPDDKQELDEALQREIQAAFRTDEIRRTPPTPQDEMRAGMSYFHETIWKGVPKFLRRVDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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