当前解析结果
SmilChr06G001757| 统一基因 ID | SmilChr06G001757 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001757 |
| 描述 | histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 20546376 - 20553478 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987425 |
|---|---|
| GeneID | 130987425 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130987425 |
| 原始查询 | LOC130987425 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 |
| 产物 | histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 |
| 拟南芥 | AT2G44150 (ASHH3)histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819021] identity=65.05; qcov=0.992; evalue=2.9e-156; confidence=high |
| 水稻 | Os09g0307800 (SDG724)- identity=53.78; qcov=0.951; evalue=4.35e-124; confidence=high |
| GO | GO:0000785 (chromatin); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046975 (histone H3K36 methyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00856 (SET) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987425 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766940.1 |
| 2 | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766943.1 |
| 3 | 染色体 | 0.20000 | XP_057766940.1 |
| 4 | 核质 | 0.20000 | XP_057766940.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:20546808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr6:20550677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:20550792 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr6:20550851 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766940.1PF00856
SET 126-232 aa
XP_057766942.1PF00856
SET 126-232 aa
XP_057766943.1PF00856
SET 67-173 aa
XP_057766944.1PF00856
SET 67-173 aa
XP_057766945.1PF00856
SET 126-232 aa
XP_057766946.1PF00856
SET 126-232 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766940.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 126 | 232 | 4.1e-26 | 92.2 | SET domain |
XP_057766942.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 126 | 232 | 3.9e-26 | 92.3 | SET domain |
XP_057766943.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 67 | 173 | 3.2e-26 | 92.6 | SET domain |
XP_057766944.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 67 | 173 | 3e-26 | 92.6 | SET domain |
XP_057766945.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 126 | 232 | 2.7e-26 | 92.8 | SET domain |
XP_057766946.1 |
Pfam | PF00856 |
SET | Family | 126 | 232 | 2.6e-26 | 92.8 | SET domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA6 records
下载 CDS FASTA6 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。