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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002836`

染色体: Chr01 坐标: 46954338-46957760 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002836`
名称	SmilChr01G002836
描述	12-oxophytodienoate reductase 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46954338 - 46957760 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987464`
GeneID	`130987464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987464`
原始查询	`LOC130987464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	12-oxophytodienoate reductase 3
产物	12-oxophytodienoate reductase 3
Arabidopsis	`AT2G06050` (OPR3) oxophytodienoate-reductase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815160] identity=72.1; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0459600` (OPR7) - identity=72.2; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome); GO:0009695 (jasmonic acid biosynthetic process); GO:0010181 (FMN binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0031408 (oxylipin biosynthetic process)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00724 (Oxidored_FMN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766980.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057766980.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766980.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766980.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46954652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B57,B88
`Chr1:46954934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:46954944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B82
`Chr1:46954949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B87,C56
`Chr1:46954954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:46955208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:46955223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:46955281`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A18,A3,B112,B140,B42,B55,B73,C2,C29,C4,C52,C53,C56,C57,C77,C82
`Chr1:46956123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B13,B140,D10
`Chr1:46956142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B41,C1,C4,C52
`Chr1:46956975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C23
`Chr1:46957015`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766980.1

393 aa

196

393

Oxidored_FMN

PF00724 Oxidored_FMN 7-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766980.1`	Pfam	`PF00724`	Oxidored_FMN	Domain	7	357	2.6e-83	280.9	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910997.1
GGAGCAATAATTTGCATCCAGATGGATGACGAACTGTTGACCACAGACAAATGGAATCGCCCACCAATTACTTTACTAGTTTGCATATGAAAATCGTGCGCAATACCAATGCTAAATTCAAAATGCAGTAATTTATTTGGCCTACTCCACCCCACTAGTATTCATTATTCATTATCCTCCTCCGCCCCCGATCAAGATCACCGTCCTCCTCCTCCCCTAACTTCACCGTCCACGCGTACACCGCCCTCCTTTAAATAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987464
ATGGCGGAAACGAAGCCGTCTCTCTTCTCCCCTTACAAGATGGGCCAGTACAATCTCTCACACAGGGTGGTTTTGGCGCCGATGACTCGATGCAGAGCGCTGAACGCCATGCCTAATTCCGCCCTAGCTGAGTACTACGAGCAGAGAGCCACGGACGGCGGATTTCTGATCACGGAGGGCACCATGATCTCCCCCTATTCCGCAGGGTTCCCGCACGTGCCGGGCATCTTCAACAAGGAGCAAGTGGAGGCGTGGAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766980.1
MAETKPSLFSPYKMGQYNLSHRVVLAPMTRCRALNAMPNSALAEYYEQRATDGGFLITEGTMISPYSAGFPHVPGIFNKEQVEAWKPVVERVHAKGAVIFCQLWHVGRASHPELQPGGIEPISSTDKPISKRWRVLLPNGKYEIYPKPRKLETHELPELVHQYRQSAINAIEAGFDGIEIHGAHGYLLDQFMKDGINERTDEYGGSLQNRCKFIIQVVEAVVFAIGADRVGVRISPAIDHLDAMDSNPHSLGLAVIERLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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