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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002862`

染色体: Chr01 坐标: 47216517-47219785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002862`
名称	SmilChr01G002862
描述	subtilisin-like protease SBT1.8
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47216517 - 47219785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987701`
GeneID	`130987701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987701`
原始查询	`LOC130987701`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT1.8
产物	subtilisin-like protease SBT1.8
Arabidopsis	`AT2G05920` (AT2G05920) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815145] identity=68.1; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0441000` (OsSub57) - identity=59.7; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057767310.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057767310.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057767310.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767310.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47216681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:47217022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C70,D9
`Chr1:47217053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B30,B75,C16
`Chr1:47217075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr1:47217075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47217292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47217302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B130,C34
`Chr1:47217338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:47217340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:47217395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47217401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:47217410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767310.1

763 aa

382

763

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 27-106 aa PF00082 Peptidase_S8 136-582 aa PF02225 PA 375-458 aa PF17766 fn3_6 660-757 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767310.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	27	106	2.1e-18	67.5	Peptidase inhibitor I9
`XP_057767310.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	136	582	3.1e-48	165.2	Subtilase family
`XP_057767310.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	375	458	1.9e-12	47.9	PA domain
`XP_057767310.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	660	757	2.8e-26	92.3	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911327.1
GCTTCTATCCACTGACAGTCTTCACCCGACTGTCTCTCACTCCCTCTCACATACTTACACTTATATATATGTATTTACATCTCCCTCAATAAAATAAAATATATATGTATTTACATCTCTGTTGAAAGAGAGATTTCATCAAGCTTTTTAAAAATGGCGACGCGCTTTGCAATCTGCCTCTGCGCAATTGCGCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTCCGATTCTCGCCAAGCAGACCTACATTGTGCACATGAAGCACCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987701
ATGGCGACGCGCTTTGCAATCTGCCTCTGCGCAATTGCGCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTCCGATTCTCGCCAAGCAGACCTACATTGTGCACATGAAGCACCACCTGAAGCCGGCAGCCTACGCCACCCACGGCGACTGGTACTCCGACCACCTGCAGGCCATCACCTCCGACGACGCCGCCGCCGATTCAATCCTCTACACCTACGACTCCGCCTACCACGGCTTCGCCGCCGCCCTCTCGCCGGAGGATGCCGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767310.1
MATRFAICLCAIALFQSCLLPILAKQTYIVHMKHHLKPAAYATHGDWYSDHLQAITSDDAAADSILYTYDSAYHGFAAALSPEDAESLRQSDAVLGVYEDTVYTLHTTRTPEFLGLEAVAGKWAGHSLQELNQASQDVIVGILDTGVWPESKSFADVGMPDIPTRWRGECEAAADFNPKIHCNKKLIGARFFSRGYNMMASSGGEKETQSPRDNDGHGTHTASTAAGSPVANASLLGYASGNARGMAPHARVAAYRVCWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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