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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002865`

染色体: Chr01 坐标: 47249276-47257103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002865`
名称	SmilChr01G002865
描述	uncharacterized SmilChr01G002865
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47249276 - 47257103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987726`
GeneID	`130987726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987726`
原始查询	`LOC130987726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838494]; symbol=AT1G19110; hit=AT1G19110; species=arabidopsis; confidence=high
产物	inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838494]; symbol=AT1G19110; hit=AT1G19110; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19110` (AT1G19110) inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838494] identity=55.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0407000` - identity=45.4; qcov=0.486; evalue=1.55e-110; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00092 (VWA); PF13519 (VWA_2); PF13768 (VWA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057767359.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767359.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767359.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767359.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47249446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:47249537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B32,B75
`Chr1:47250066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B130,C34
`Chr1:47252223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B79,C11,C2,C69
`Chr1:47253542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:47253546`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A11
`Chr1:47253546`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A11
`Chr1:47253983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47255433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B73,C23
`Chr1:47256443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767359.1

753 aa

376

753

VWA_3

VWA_2

VWA

PF13768 VWA_3 327-483 aa PF13519 VWA_2 328-433 aa PF00092 VWA 328-493 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767359.1`	Pfam	`PF13768`	VWA_3	Domain	327	483	1.3e-13	52.0	von Willebrand factor type A domain
`XP_057767359.1`	Pfam	`PF13519`	VWA_2	Domain	328	433	2.1e-10	41.9	von Willebrand factor type A domain
`XP_057767359.1`	Pfam	`PF00092`	VWA	Domain	328	493	8.3e-10	39.9	von Willebrand factor type A domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911376.1
GCATCAAATGCTTGTACATTTGAGACATGAAACTCCCTCAGCTTCTGCACCCACGCAACGTACATGAATGCGTAGCTTGAACTCAAAGTGGTCTCGTCGCATGGGATAAGAGGTGGGCTCCACGTCTCCAACGGCCACCTACAACTCGGTATAATAAACGCCAAGACCTAGATCATCGGCTACAGTCTTCAAGGAAAGGAAATTCCAGCTCAACGGTCGCATTGCAGGTGATAATCGTCGGATTCCCCCGTTTTCGTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987726
ATGGCGGCGGATTTCGAGGCCGCGGTGGAGGACGGGCTGCGCCTCTCCAAGAGGATATACTTCGGCAAGGACAGGGCGGTGGCGCCGCCCAAGCCCCACACGGCCATGGAGCGAGCCGCCGGCTGCTCCTACCTCCCTAATTCCCCAATGCTCTACGCCGTCATCACCGACCCAGCCGTCGTCGACAACCCGGACATGCCTAGCTACCAGCCGCACGTGCACGGCAGGTGCACCCCCCCGGCCCTAATCCCGCTCCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767359.1
MAADFEAAVEDGLRLSKRIYFGKDRAVAPPKPHTAMERAAGCSYLPNSPMLYAVITDPAVVDNPDMPSYQPHVHGRCTPPALIPLQMNGVLLEVDCYLDTAFVTVTGTWRVHCVMGSRSCDCRIAVPMGEQGSILGVEVEVPRKSYSTEFISVDNEKGPENVGKTEGAGFLKAHIFTLTVPQVDGGTNISVKLRWSQKLLYHDGQFTLRIPFSFPEYVTPAAKKISKREKIELNVNAGPETEILCKTTSHPLKERLRQAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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