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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000415`

染色体: Chr06 坐标: 3435914-3444620 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000415`
名称	SmilChr06G000415
描述	uncharacterized SmilChr06G000415
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3435914 - 3444620 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987965`
GeneID	`130987965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987965`
原始查询	`LOC130987965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal recognition particle-related / SRP-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836318]; symbol=AT5G61970; hit=AT5G61970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	signal recognition particle-related / SRP-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836318]; symbol=AT5G61970; hit=AT5G61970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G61970` (AT5G61970) signal recognition particle-related / SRP-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836318] identity=72.7; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0323000` - identity=64.4; qcov=0.729; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005047 (signal recognition particle binding); GO:0005786 (signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting); GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane); GO:0008312 (7S RNA binding); GO:0030942 (endoplasmic reticulum signal sequence receptor activity)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF16969 (SRP68)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767679.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767679.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767679.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767679.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3437715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B35,B82,D7
`Chr6:3438177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:3438946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:3438949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:3441608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:3441638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:3442040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767679.1

601 aa

300

601

SRP68

PF16969 SRP68 44-579 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767679.1`	Pfam	`PF16969`	SRP68	Family	44	579	1.2e-157	527.1	RNA-binding signal recognition particle 68

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911696.1
AGAACTAAAATTCACAAATAAGTTGACAACATGATTTAACCTAATCCTATTTCTAAATTCGACCCATAAAAAACAAATTGGGTCAAACCCGACCCACAGGTTTGCGACCCGACCCTCTAAATTACTCGCATATCACTGTACGAGAATCAACAGTAGAGGCAGACATCAAGTCATCAACTTCGGCGTTACAAAAGTGAACCCCTTCACAAAATCCGCCGCTGCTACCGCACCCGCCGGCGCACCGTAGAATCCACCGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987965
ATGGCGAAGGGAGACGACGTCACTGGGATGGAAATCGATCAGAATTCATCCGCCTCGGATCAGATTAGTAACCCTAAATTCTCTATCAATGTGCTGCAGCTATTGAAATCAGCACAAATGCAGCACGGGTTGCGCTTCAGTGATTACGCTCGTTACAGGAGATACTGCACTGCACGCCTGCGGAGACTGTATAAGTCCTTGAAATTCACCCATGGCCGTGGAAAATATACCAAGAGAGCCATATCGTCAACCACCGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767679.1
MAKGDDVTGMEIDQNSSASDQISNPKFSINVLQLLKSAQMQHGLRFSDYARYRRYCTARLRRLYKSLKFTHGRGKYTKRAISSTTVTEVRFLHLVLYAAERAWSHAMEKKTLPDGPNARQRSYLIGRLRKAVKWAAQFQELCAIKGDSRTSLEAEAYASYMKGSLLFEQDEHWDIALKCFKSARAVYEELGKYGDLENQVLCRERVEELEPSIRYCLHKVGESNLQTSELVQIGEMEGPALDLFKAKLEAVMAEARSQQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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