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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000433`

染色体: Chr06 坐标: 3556059-3560733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000433`
名称	SmilChr06G000433
描述	glycine--tRNA ligase, mitochondrial 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3556059 - 3560733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987983`
GeneID	`130987983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987983`
原始查询	`LOC130987983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine--tRNA ligase, mitochondrial 1-like
产物	glycine--tRNA ligase%2C mitochondrial 1-like
Arabidopsis	`AT1G29880` (AT1G29880) glycyl-tRNA synthetase / glycine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839866] identity=82.3; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0538000` - identity=81.8; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004820 (glycine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0070150 (mitochondrial glycyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00587 (tRNA-synt_2b); PF03129 (HGTP_anticodon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767699.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767699.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767699.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767699.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3556217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:3556223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C63
`Chr6:3557079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C13
`Chr6:3557109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A4,B31,B8,C3
`Chr6:3557262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:3557267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B35,C85,D7
`Chr6:3558071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:3560425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C40
`Chr6:3560425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr6:3560439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:3560496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767699.1

621 aa

310

621

tRNA-synt_2b

HGTP_anticodon

PF00587 tRNA-synt_2b 189-487 aa PF03129 HGTP_anticodon 514-601 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767699.1`	Pfam	`PF00587`	tRNA-synt_2b	Domain	189	487	3.5e-12	47.5	tRNA synthetase class II core domain (G, H, P, S and T)
`XP_057767699.1`	Pfam	`PF03129`	HGTP_anticodon	Domain	514	601	7.1e-19	68.5	Anticodon binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911716.1
GCAATTTAGCGATACTCGCTACACTCCCAGCGAAGGAGTATATATTCTCCAAATTGAGGGCTTTTAGCTCTGAACCCAAAACCTTCTTCACTCACTGAGAAAATGGACGCCGCGCAAGAAGCTCAGAGGCGGGAGGCTTTCCGGCACGCCGTTGTCAACGCGCTCGAACGGCGGCTGTTCTACATCCCTTCCTTCAAGATCTACCGCGGCGTCGCCGGACTTTACGATTATGGCCCCCCTGGTTGCGCCGTCAAGGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987983
ATGGACGCCGCGCAAGAAGCTCAGAGGCGGGAGGCTTTCCGGCACGCCGTTGTCAACGCGCTCGAACGGCGGCTGTTCTACATCCCTTCCTTCAAGATCTACCGCGGCGTCGCCGGACTTTACGATTATGGCCCCCCTGGTTGCGCCGTCAAGGCCAATGTCCTCGCGTTCTGGCGCCAGCACTTTGTTCTAGAAGAGAACATGTTGGAAGTTGATTGCCCGTGTGTTACCCCGGAGATTGTGCTGAAGGCGTCTGGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767699.1
MDAAQEAQRREAFRHAVVNALERRLFYIPSFKIYRGVAGLYDYGPPGCAVKANVLAFWRQHFVLEENMLEVDCPCVTPEIVLKASGHVDKFTDLMVKDEKTGTCYRADHLLKDYCKEKLEKDPKLSEEKAAELRHVLAVLDEFSAEELGAKIKEYGITAPDTKNSLSDPYPFNLMFQTSIGPSGSSTGYMRPETAQGIFVNFKDLYYYNGNKLPFAAAQIGQAFRNEISPRQGLLRVREFTLAEIEHFVDPDDKSHPKFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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