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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000552`

染色体: Chr06 坐标: 4643764-4646372 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000552`
名称	SmilChr06G000552
描述	NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4643764 - 4646372 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988096`
GeneID	`130988096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988096`
原始查询	`LOC130988096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
产物	NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase
Arabidopsis	`AT2G24270` (ALDH11A3) aldehyde dehydrogenase 11A3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816962] identity=90.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0440800` (OsALDH11A3) - identity=88.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008911 (lactaldehyde dehydrogenase (NAD+) activity)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00171 (Aldedh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767840.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767840.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057767840.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057767840.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4644288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C65
`Chr6:4644492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr6:4644534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C65
`Chr6:4645531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:4645741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:4645743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4645755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:4645941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767840.1

496 aa

248

496

Aldedh

PF00171 Aldedh 27-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767840.1`	Pfam	`PF00171`	Aldedh	Family	27	483	1.3e-142	476.3	Aldehyde dehydrogenase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911857.1
GAGACAAAAGGCCATTAAAAAAAAGCGAGAAAAAGAGACATATGGTCCAAAAATGATGGAAGAAGAAATGTGGCTCAGCTTATTCCACCAGAAAAACAGAAAACTCTAGATATACGCAGGCAGCTACCAAAGTCCAAGAAAGCCGACACTTTCCTTCCTTCATTTATCTCCCACACTCTTATAAGACTCTCACCTCCCAACAACAACCATCTTCATCTCTTCAATGGCCGGCACCGGAGCTTTTGCAGAGATCATCGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988096
ATGGCCGGCACCGGAGCTTTTGCAGAGATCATCGATGGAGATGTCTTCAAGTACTACGCCGACGGAGAATGGAAGATATCCTCTTCCGGAAAATCCGTCGCCATTGTCAATCCTACCACAAGGAAGACTCACTACAAAGTTCAAGCTTGCACGCAGGAGGAGGTGAACAAGGTGATGGAGACCGCGAAAGCCGCGCAGAAATCGTGGGCGAAGACGCCGCTGTGGAAGCGCGCGGAGCTCCTCCACAAAGCCGCCGCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767840.1
MAGTGAFAEIIDGDVFKYYADGEWKISSSGKSVAIVNPTTRKTHYKVQACTQEEVNKVMETAKAAQKSWAKTPLWKRAELLHKAAAILKEHKAPIAEALVKEIAKPAKDSVTEVVRSGDLISYCAEEGVRVLGQGTFLVSDSFPGNERTKYCLTSKIPLGVVLAIPPFNYPVNLAVSKIAPALVAGNSLVLKPPTQGAVACLHMVHCFHLANFPKGLISCITGRGSEIGDFLTMHPGVNCISFTGGDTGIAISKKAGMIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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