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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000857`

染色体: Chr06 坐标: 8114372-8115961 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000857`
名称	SmilChr06G000857
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8114372 - 8115961 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988390`
GeneID	`130988390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988390`
原始查询	`LOC130988390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
产物	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD12-like
Arabidopsis	`AT4G21160` (ZAC) Calcium-dependent ARF-type GTPase activating protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827864] identity=64.5; qcov=0.756; evalue=3.18e-97; confidence=high
Rice	`Os02g0722500` - identity=58.9; qcov=0.728; evalue=2.59e-81; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005543 (phospholipid binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768197.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768197.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768197.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768197.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8114392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,C17,C18,C41,C82
`Chr6:8114395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:8114411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C87
`Chr6:8114510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A13,A8,B118,B30,B48,C1,C26,C42,C47
`Chr6:8114694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B3,B94
`Chr6:8114702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B61,B64,C26,C74,C81,C87
`Chr6:8114742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B9
`Chr6:8114748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B36,C10
`Chr6:8114755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B36,C10
`Chr6:8114996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B7,C42,C52,C9
`Chr6:8115000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B8,C78
`Chr6:8115079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768197.1

287 aa

144

287

PF00168 C2 133-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768197.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	133	220	3.2e-23	82.6	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912214.1
ACGCCGCTCACTGCCATGGTCTTCGAGATTCGGGTGAGTGGTTGTCACCTCCACTCTGTCGTTACCTCTCTCACTCACTCTCACGAACAGATCTCCCTCACACACGAAGAGAATAGAAACCGAGTCCTAGCTCTCTCTCGACTCTCCTTGGTTAAGGGTAGCCGCAATTCTCCCATTTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAAAATCAGCAGCTGCAGTATTACTGATTTCTATTCTTTATGTGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988390
ATGGTCTTCGAGATTCGGGTGAGTGGTTGTCACCTCCACTCTGTCGTTACCTCTCTCACTCACTCTCACGAACAGATCTCCCTCACACACGAAGAGAATAGAAACCGAGTCCTAGCTCTCTCTCGACTCTCCTTGGTTAAGGGTAGCCGCAATTCTCCCATTTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCCACTGCAGCTAAAAATCAGCAGCTGCAGTATTACTGATTTCTATTCTTTATGTGATCTTTGTAGGTCTAAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768197.1
MVFEIRVSGCHLHSVVTSLTHSHEQISLTHEENRNRVLALSRLSLVKGSRNSPISKLSFLSHPLQLKISSCSITDFYSLCDLCRSKYEQQAFLKPSLRIQSGSAKQSLQASLSRKIVNSLRSSNSSENSEYIGTMKVKVLKGSNLAVRDMLSSDPYIVLTLGQQKVQTSVVNSYLNPVWNEELTLSIPHDYSQVKLQVYDHDTFSADDIMGEADIDIQPMITSALAYGDARKFADMQIGKWLKSYDNALIEDSPVNIVAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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