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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000992`

染色体: Chr06 坐标: 9797015-9799451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000992`
名称	SmilChr06G000992
描述	inositol oxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9797015 - 9799451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988526`
GeneID	`130988526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988526`
原始查询	`LOC130988526`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inositol oxygenase 2-like
产物	inositol oxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT2G19800` (MIOX2) myo-inositol oxygenase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816499] identity=81.5; qcov=0.905; evalue=9.38e-176; confidence=high
Rice	`Os06g0561000` (OsMIOX) - identity=68.6; qcov=1.02; evalue=2.17e-158; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0019310 (inositol catabolic process); GO:0050113 (inositol oxygenase activity)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05153 (MIOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768384.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768384.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057768384.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768384.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9797290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:9797356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:9797358`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr6:9797358`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr6:9797672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B97,C71,C83,D6
`Chr6:9797690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768384.1

304 aa

152

304

MIOX

PF05153 MIOX 55-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768384.1`	Pfam	`PF05153`	MIOX	Family	55	304	4.8e-126	420.1	Myo-inositol oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912401.1
CCAATCATACAACATCAAACAACACAAGGCCATTTCATTGTGATTATCTCCTATACATTGAAACGGCCTTTATTTCCCTCTTCATATATATCTCCTAGTTTTCATTGTTTTGAAATCTTTTGTTGCCAAACATGACCATCCTCGTTGACCAGCCCCAGCTCCAGCTCCAACTTGACTGTGTGCCCATTGAGGAGAAGAAACTGGGCCAATCGCAAGGCGTATTCGAGGCTCCCGACATCAATGCTTTTGGCCAAACCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988526
ATGACCATCCTCGTTGACCAGCCCCAGCTCCAGCTCCAACTTGACTGTGTGCCCATTGAGGAGAAGAAACTGGGCCAATCGCAAGGCGTATTCGAGGCTCCCGACATCAATGCTTTTGGCCAAACCTTCAGGGACTACACTAATGCTGAGACCGAGAGGCAAAAAGGGGTTGAGGAATTCTATAGATTGCAACACATCAACCAGACATATGATTATGTTAAGCAGATGAGAGAAAAGTTTTCAAAACTGGACAAAATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768384.1
MTILVDQPQLQLQLDCVPIEEKKLGQSQGVFEAPDINAFGQTFRDYTNAETERQKGVEEFYRLQHINQTYDYVKQMREKFSKLDKMEMSIWECCELLNEVVDESDPDLDEPQIQHLLQSAEAIRKDYPDQDWLHLTALIHDLGKVLLLPKFGGLPQWAVVGDTFPLGCAFDGSNIHHKYFKENPDSKNSAYFTKNGVYEEGCGLENVVMSWGHDDYMYLVATENGTTLPSAALFIIRYHSFYPLHRAGAYKHLMNDEDRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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