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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001027`

染色体: Chr06 坐标: 10183593-10190866 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001027`
名称	SmilChr06G001027
描述	4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10183593 - 10190866 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988561`
GeneID	`130988561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988561`
原始查询	`LOC130988561`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmPPT` P030; 2019	`MH707439`	`LOC130988561` `SmilChr06G001027` GeneID 130988561	nucleotide; identity 100.0%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, mitochondrial
产物	4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G23660` (PPT1) polyprenyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828466] identity=62.4; qcov=1.06; evalue=7.85e-157; confidence=high
Rice	`Os08g0322600` (OsPPT1a) - identity=78.8; qcov=0.746; evalue=4.27e-161; confidence=high
GO	GO:0004659 (prenyltransferase activity); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006744 (ubiquinone biosynthetic process)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01040 (UbiA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768431.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057768431.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057768431.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768431.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10183665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10183731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:10183867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr6:10185751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B80,B99,C30
`Chr6:10185874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10187771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B52,B77,C12
`Chr6:10187780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:10187791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768431.1

393 aa

196

393

UbiA

PF01040 UbiA 129-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768431.1`	Pfam	`PF01040`	UbiA	Family	129	374	1.4e-58	198.9	UbiA prenyltransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912448.1
ATGGCATTTCATGGCTTATCCCGAACCGCTCGGAGCCTCCGCAAGCTCCGCCAGCGCCACTCGTCTCTCTCCGCCGTGCACACTTATTTCCACTCGCCTCCACCCTCCGCCGACTCGTGCCACCTCTTCCAAGTCTCCGGAATTTTTCCCTCCAAAAATCAAGTTTACAATGACAGCAATTCATTCCGGTCAATTGGAGCCTATCACCATCTTCTTCAGTATTCTAGCTTTTCCACTGTACCATCCGATGAGAAACGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988561
ATGGCATTTCATGGCTTATCCCGAACCGCTCGGAGCCTCCGCAAGCTCCGCCAGCGCCACTCGTCTCTCTCCGCCGTGCACACTTATTTCCACTCGCCTCCACCCTCCGCCGACTCGTGCCACCTCTTCCAAGTCTCCGGAATTTTTCCCTCCAAAAATCAAGTTTACAATGACAGCAATTCATTCCGGTCAATTGGAGCCTATCACCATCTTCTTCAGTATTCTAGCTTTTCCACTGTACCATCCGATGAGAAACGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768431.1
MAFHGLSRTARSLRKLRQRHSSLSAVHTYFHSPPPSADSCHLFQVSGIFPSKNQVYNDSNSFRSIGAYHHLLQYSSFSTVPSDEKREKSKNSKGNECDRSWIDVYLPEKARPYARLARLDKPIGTWLLAWPCMWSITMAAAPGSLPDIKMMMIFGTGALLLRGAGCTVNDLLDRDIDTKVDRTRSRPIASGVLSPFRGICFLGFQLLLGLEILLQLNNFSRVLGASSLLLVFSYPLMKRLTYWPQAYLGLTFNWGALLGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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