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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003012`

染色体: Chr01 坐标: 49159050-49166685 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003012`
名称	SmilChr01G003012
描述	uncharacterized SmilChr01G003012
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49159050 - 49166685 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989043`
GeneID	`130989043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989043`
原始查询	`LOC130989043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0123100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0123100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G35430` (AT5G35430) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833507] identity=42.6; qcov=0.999; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0123100` - identity=45.1; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006402 (mRNA catabolic process); GO:0017148 (negative regulation of translation); GO:0030014 (CCR4-NOT complex)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF27626 (CNOT10_TPR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769024.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769024.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769024.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49159586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C42,C44,C55
`Chr1:49161746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C42,C44,C55
`Chr1:49161834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:49164610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:49164836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B131,B91,C57
`Chr1:49165104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B65
`Chr1:49165177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:49165330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:49165788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49165804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:49165805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr1:49165901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769024.1

846 aa

423

846

CNOT10_TPR

PF27626 CNOT10_TPR 647-824 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769024.1`	Pfam	`PF27626`	CNOT10_TPR	Repeat	647	824	1.4e-66	224.2	CNOT10 tetratricopeptide repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913041.1
CAAATCTCATGACTTAAAACTATAATTACCCATTAATGTTACGTTTCTGTATGACAAAATAAAATGAAATATGTTTGCAAGTAATTAAAAGTGCCTCAATTATGATTATCTATCTAGATTTTCTCACCCATCCCATCCCCAATTTGCTAAATCCATCTCCGCCTCCACTCTTTCTCTTTCTAAATCAACGCATCGCAATAGATACATACAGGCTCAATAAAAATATATGCGTACATGTTTGCGTATGTATATCCTCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989043
ATGGATTCCCCCTCTTCGTCAGTGGCATTGACTACAAGAGACGGATCGCCGTCCGCGGCGGCGGGGGAGGACGACGGTGCTCTGTTCGCGGAGGGTCTTGCTAAGGAGGCTGCTGTGCTGTTTCAGACTGGGAAGTTCGCGGACTGTTTGAGAATTTTGAACCAGTTATTGCAGAAGAAGGAGGATGATACGAAGGTCTGCCATAATGTTGCCATTGCGGAGAGCTTACAAGATGGATGCTCAGATCCTAGAAAGCTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769024.1
MDSPSSSVALTTRDGSPSAAAGEDDGALFAEGLAKEAAVLFQTGKFADCLRILNQLLQKKEDDTKVCHNVAIAESLQDGCSDPRKLIKALEKIKEQSEGHACASGEHLEGFSNNGSEHTSRIRGNNAPPHPISSFMYNDEFDTSVATFNIAVIWYHLHEYTRSLSYLDTLYQNIEPIGEGTALRICLLLLDVALLSHNASRSADVISYMEKVFFVSSMGNQVDNGSSAHQQPLLVPKSTSLPNNSTLHDGSHPDSTSENS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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