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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002652`

染色体: Chr06 坐标: 38340510-38345024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002652`
名称	SmilChr06G002652
描述	phosphoglucan phosphatase LSF1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38340510 - 38345024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989391`
GeneID	`130989391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989391`
原始查询	`LOC130989391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglucan phosphatase LSF1, chloroplastic-like
产物	phosphoglucan phosphatase LSF1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G01510` (LSF1) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821127] identity=70.9; qcov=0.845; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0379300` (OsPP100) - identity=62.5; qcov=0.846; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005983 (starch catabolic process); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0008138 (protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0019203 (carbohydrate phosphatase activity); GO:0043036 (starch grain)
KEGG	-
Pfam	PF00782 (DSPc); PF16561 (AMPK1_CBM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769353.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769353.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769353.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769353.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38340746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B114,B134,B84,C80
`Chr6:38340789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C18
`Chr6:38340837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:38341725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C39,C69
`Chr6:38341887`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr6:38341887`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68
`Chr6:38342363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:38342662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B57,D11
`Chr6:38343100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769353.1

618 aa

309

618

DSPc

AMPK1_CBM

PF00782 DSPc 327-455 aa PF16561 AMPK1_CBM 485-566 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769353.1`	Pfam	`PF00782`	DSPc	Domain	327	455	1.4e-11	45.1	Dual specificity phosphatase, catalytic domain
`XP_057769353.1`	Pfam	`PF16561`	AMPK1_CBM	Family	485	566	4.1e-20	72.5	Glycogen recognition site of AMP-activated protein kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913370.1
ATCCAAAATTTTTACGGAAAAGGTGAACGGACGGCCATTAAATGGAGCAGTGCACCGGAAGTATGCAATCCGCCACCGCGAGTGAATCGGGAAGGGAAAGATCTTTTGAGCGATGACGTGGCAATAAAGCAAACAAAATCGGTTTGGCTGTCACGTGGAAGTTCCCCGCTCTATGGTCACTCAACTCCTCCATACCCAAATCTCCAATCTCTATGCTCTTCTCGAGATTTACCGCACTTCATTTGGATTTGCGTGTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989391
ATGGTCACTCAACTCCTCCATACCCAAATCTCCAATCTCTATGCTCTTCTCGAGATTTACCGCACTTCATTTGGATTTGCGTGTCAATTGCTCGAAATGTGTTCTCTGCAGCTCTCCAATTGCAGAGCCTTCGAGCACTCGGAATTCCGGAGGGAGCTGAGGCGCAGCAGTGCCGCCGTGATTCGCTCCTCGTTCTGGGGAGGACCTTTGGATTTGAGCGATGCGGAGGCGCGGGGGAGTAGGACGCGGCGCTTGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769353.1
MVTQLLHTQISNLYALLEIYRTSFGFACQLLEMCSLQLSNCRAFEHSEFRRELRRSSAAVIRSSFWGGPLDLSDAEARGSRTRRLLARRTSRIFAEIKMNPNEYMVTLEKPLGIRFALSVDGKVFVLALQKGGNAEKLGLIMVGDTLKKAGQSSDGKLVEIKDFSDTETLRKEKSGAYSLVLERPFAPFPTHQLFPMDDIDIMFNRGRVPIATWNKSIGASNLQESSESSGNSGFAVFCPKFLSSKGWKCLNDQNRNGLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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