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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002831`

染色体: Chr06 坐标: 41109588-41114037 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002831`
名称	SmilChr06G002831
描述	cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41109588 - 41114037 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989577`
GeneID	`130989577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989577`
原始查询	`LOC130989577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic
产物	cystathionine gamma-synthase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G01120` (MTO1) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821292] identity=82.3; qcov=0.752; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0399200` - identity=56.7; qcov=0.782; evalue=1e-169; confidence=high
GO	GO:0003962 (cystathionine gamma-synthase activity); GO:0009086 (GO:0009086); GO:0009507 (chloroplast); GO:0019346 (transsulfuration); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01053 (Cys_Met_Meta_PP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769540.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769540.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769540.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769540.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41112290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr6:41113579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr6:41113619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769540.1

541 aa

270

541

Cys_Met_Meta_PP

PF01053 Cys_Met_Meta_PP 156-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769540.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	156	539	2e-135	452.0	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913557.1
AAAATGGTTAGAGAGGAGCAACTTGTCATTTAAAATAATAAAAAAGAAAATGTAGGAAATAGTACAAGTCCAAGAAACGAATCTAGAGGAGTGTTTATCGGAAGGCTATATAAGAACGACAAACTCTAGCCCCGTTTACTTCCTAGTCCAGAGAGAGAAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTCACCAGAATTTGTGAACTCTATTCAGCATCCAAAATAGGATTTTTTTTCATTTCCATTTCCAACCCTCCTCCCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989577
ATGGCCGTTTCCAGCTTCGCTAGGGCATTTCCCTCCTTCGAGTGCCGCTCCGATCCCGACTTCTCCCTGCCGGAGATTCCTTCACCTCGATATGGCGCAGGATCCAAATCCGCCGTCCTCCGCGGCGGCGCCGGAGCGTACGGTCTTTCGTCGCTCATCCTGAAGTTTCCCCCGAATTTCGTGCGCCAGCTCAGCGTCAAGTCGCGGAGAAATTGCAGCAACATTGGCGTCGCCCAAATCGTGGCGGCTTCTTGGTCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769540.1
MAVSSFARAFPSFECRSDPDFSLPEIPSPRYGAGSKSAVLRGGAGAYGLSSLILKFPPNFVRQLSVKSRRNCSNIGVAQIVAASWSNNQGAPAPTPAATAVDAAAAAAAAAPVELDTGAANGVLPVKDPCCDGENVQIDDSPKFKYASFLNSDGSVAIHAGERLGRAIATDAITTPVFNTSAYFFKKTADLIDFKEKRRASFEYGRYGNYTTLVAEEKISALEGAESTLLMASGMCVSTVMLMALVPAGGHLVTTTDCYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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