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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002878`

染色体: Chr06 坐标: 41589278-41596120 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002878`
名称	SmilChr06G002878
描述	flap endonuclease 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41589278 - 41596120 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989641`
GeneID	`130989641`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989641`
原始查询	`LOC130989641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flap endonuclease 1
产物	flap endonuclease 1
Arabidopsis	`AT5G26680` (AT5G26680) 5'-3' exonuclease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832721] identity=84.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0540100` (OsFEN1) flap endonuclease 1-A-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4339464] identity=84.5; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0008409 (5'-3' exonuclease activity); GO:0017108 (5'-flap endonuclease activity)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03450 (Non-homologous end-joining - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00752 (XPG_N); PF00867 (XPG_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989641

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769655.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057769655.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769655.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769655.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769655.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41591270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B37
`Chr6:41591465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B8,C4
`Chr6:41592897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:41592962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:41593592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:41593867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769655.1

378 aa

189

378

XPG_N

XPG_I

PF00752 XPG_N 1-107 aa PF00867 XPG_I 150-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769655.1`	Pfam	`PF00752`	XPG_N	Family	1	107	2.2e-30	105.8	XPG N-terminal domain
`XP_057769655.1`	Pfam	`PF00867`	XPG_I	Family	150	234	7.4e-33	113.5	XPG I-region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913672.1
AATTGTAAGCATATACTTCCTCGCATCAAAGGCACTCTCAAATAGGCGGGAAGAACCAAAACCCTACACTCCCCACTCTCCCTTGCTACCATTTCTTTCTAACTGTCGACAAATTCCTTGCCATTTCTTCACTTTTGTGCTAATCAAATGGGAATAAAGGGTTTAACGAAGCTGTTGGCCGACAATGCGCCAAACTCGATGAAAGAGCAGAAATTTGAGAGCTATTTTGGCCGCAAAATCGCTATCGATGCCAGCATGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989641
ATGGGAATAAAGGGTTTAACGAAGCTGTTGGCCGACAATGCGCCAAACTCGATGAAAGAGCAGAAATTTGAGAGCTATTTTGGCCGCAAAATCGCTATCGATGCCAGCATGAGCATATACCAATTCCTTATTGTTGTTGGAAGAAGCGGCACTGAAATGCTCACTAATGAAGCTGGTGATGTGACTAGTCACTTGCAAGGGATGTTCTCTAGGACAATCAGACTTTTGGAGGCTGGAATTAAACCAGTCTATGTGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769655.1
MGIKGLTKLLADNAPNSMKEQKFESYFGRKIAIDASMSIYQFLIVVGRSGTEMLTNEAGDVTSHLQGMFSRTIRLLEAGIKPVYVFDGKPPDLKKQELAKRYSKRADATEDLNTAQETGNKEDIEKFSKRTVKVTKQHNDDCKKLLRLMGVPVIEAPSEAEAQCAALCKADKVYAVASEDMDSLTFGAPKFLRHLMDPSSKKIPVMEFEVSKVLEELNLTMDQFIDFCILCGCDYCDSIRGIGGMTALKLIRQHGSIENI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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