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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003300`

染色体: Chr06 坐标: 45527310-45544932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003300`
名称	SmilChr06G003300
描述	NAD-dependent protein deacylase SRT2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45527310 - 45544932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990017`
GeneID	`130990017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990017`
原始查询	`LOC130990017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD-dependent protein deacylase SRT2
产物	NAD-dependent protein deacylase SRT2
Arabidopsis	`AT5G09230` (SRT2) sirtuin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830782] identity=73.2; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0179800` (Sir2) - identity=63.3; qcov=0.974; evalue=3.91e-160; confidence=high
GO	GO:0034979 (NAD-dependent protein lysine deacetylase activity); GO:0070403 (NAD+ binding)
KEGG	smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02146 (SIR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770193.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057770194.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770193.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770193.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45530837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B22,C42
`Chr6:45532373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:45533152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770193.1

381 aa

190

381

SIR2

PF02146 SIR2 109-323 aa

XP_057770194.1

350 aa

175

350

SIR2

PF02146 SIR2 78-292 aa

XP_057770195.1

350 aa

175

350

SIR2

PF02146 SIR2 78-292 aa

XP_057770196.1

350 aa

175

350

SIR2

PF02146 SIR2 78-292 aa

XP_057770197.1

350 aa

175

350

SIR2

PF02146 SIR2 78-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770193.1`	Pfam	`PF02146`	SIR2	Family	109	323	7.9e-42	143.9	Sir2 family
`XP_057770194.1`	Pfam	`PF02146`	SIR2	Family	78	292	6.3e-42	144.3	Sir2 family
`XP_057770195.1`	Pfam	`PF02146`	SIR2	Family	78	292	6.3e-42	144.3	Sir2 family
`XP_057770196.1`	Pfam	`PF02146`	SIR2	Family	78	292	6.3e-42	144.3	Sir2 family
`XP_057770197.1`	Pfam	`PF02146`	SIR2	Family	78	292	6.3e-42	144.3	Sir2 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914213.1
ATCCTTGTTCATTTCTCACAAATTCAATCAACATTTCGCAAGAAAGAGGAGTTTCAAGTGCTGAGCTAATTCCAGCCTCCACCAAATTTCAAGCAACCAAACATCAGCAAGTTTTCCAAAGGCTTTGTGGTTCAGGAGAATTAGCGTCGCTATTCCGATTCAGAGTTATGAGTAAAACTGCAGGCATTGCCTAATCAGGAACAATGCCACTAAAGAAACGAAAGGGGAGCATTGGAGGAGCCTCGGGATCAAGAAGTGCT...

XM_057914212.1
TATTCATATTTCTTATATATGCTTTATTTTGGTGCTAGCCTATGAATTTGTTGTGGAATTTTGTTGGAATTGCTTGAATGAATGATGGGAATAGGCATTATTCATGGTGGTTCTTGTTTTTATTTGTTTGATGATTTATATGAGTAGTGTTATCTTGGGAGTTTTTGATTATGCTCAGAGGAGTACCATATTGCATTTTGTGGGGAGACTTTGCCTGTTATTGAGGGGATTAAGAGTTGAATTTTGGATTAGGGGGATGA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130990017
ATGGCTTCTCTGCACCTTCCCTTCTTTTCTAAAGTCGGTGGTACAAGAGAGTCGCTGAGGACATTATTAGCTGAAACCGTTCGATCAATTAGTATGAACAAAGAAACTTTTTGGAGGCCAAGAATGATATCTTTTCAGGGATCTCTCAAGTTTGTGCATACTTATCGCATCACACCTACTGGAGCCACAATGGAGAATAAAGAATTACCTTCAAATTACTTAAAAGACAAAATGATGGTTCCAAATGCAGATCCGCCCAG...

LOC130990017
ATGAACAAAGAAACTTTTTGGAGGCCAAGAATGATATCTTTTCAGGGATCTCTCAAGTTTGTGCATACTTATCGCATCACACCTACTGGAGCCACAATGGAGAATAAAGAATTACCTTCAAATTACTTAAAAGACAAAATGATGGTTCCAAATGCAGATCCGCCCAGAGACGAAGATGTCAATCTTCTATCTCAGTTCTTCAAGAGAAGTTCAAGGCTTGTTATCTTGACTGGAGCTGGGATAAGCACAGAGAGTGGGAT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057770193.1
MASLHLPFFSKVGGTRESLRTLLAETVRSISMNKETFWRPRMISFQGSLKFVHTYRITPTGATMENKELPSNYLKDKMMVPNADPPRDEDVNLLSQFFKRSSRLVILTGAGISTESGIPDYRSPNGAYSTGFRPITHQEFMRSSRARRRYWARSYAGWRKFTTAQPGPAHIALASLEKAGRVKFMMTQNVDRLHHRAGSNPLELHGTVYIVACTNCGFSLSRSSFQDQVKAINPKWAEAIESLDYDSRSDKSFGMKQRPD...

XP_057770194.1
MNKETFWRPRMISFQGSLKFVHTYRITPTGATMENKELPSNYLKDKMMVPNADPPRDEDVNLLSQFFKRSSRLVILTGAGISTESGIPDYRSPNGAYSTGFRPITHQEFMRSSRARRRYWARSYAGWRKFTTAQPGPAHIALASLEKAGRVKFMMTQNVDRLHHRAGSNPLELHGTVYIVACTNCGFSLSRSSFQDQVKAINPKWAEAIESLDYDSRSDKSFGMKQRPDGDIEIDEKFWEEEFHIPNCEKCDGILKPDVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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