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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000551`

染色体: Chr06 坐标: 4630357-4632634 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000551`
名称	SmilChr06G000551
描述	endoglucanase 3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4630357 - 4632634 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990074`
GeneID	`130990074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990074`
原始查询	`LOC130990074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 3-like
产物	endoglucanase 3-like
Arabidopsis	`AT4G02290` (GH9B13) glycosyl hydrolase 9B13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828080] identity=55.8; qcov=0.967; evalue=3.11e-127; confidence=high
Rice	`Os01g0312800` (OsGH9B2) - identity=75.2; qcov=0.641; evalue=7.5e-123; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057770257.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770257.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770257.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770257.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4630452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B63,B83,C30
`Chr6:4630864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B108,B131,B96
`Chr6:4631063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B56,B96
`Chr6:4631857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr6:4631890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B79
`Chr6:4631915`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B11,B133,B52,B77,B96,C1,C19,C25,C74,C85
`Chr6:4631958`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A13,A2,A25,B117,B135,B140,B15,B17,B20,B22,B24,B31,B34,B35,B43,B48,B54,B57,B67,B75,B77,B83,B95,C1,C11,C14,C24,C31,C34,C39,C54,C67,C69,C73,C79,C8,C83,D2
`Chr6:4631967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:4631969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B56,B92,B95
`Chr6:4632347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,D6
`Chr6:4632351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770257.1

365 aa

182

365

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 8-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770257.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	8	352	1.4e-86	292.2	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914274.1
ATGATCACGCTTGTTCATAAAGTGCTGCAGGTTGGAGATGCCGGAAAGGATCACGCTTGTTGGGAAAGGCCCGAGGACATGGACACACCAAGAAGCGTGATCAAGATTGACAAGAACACCCCTGGCACAGAAGTTGCAGCTGAGACTGCTGCTGCTCTTGCTGCTGCTTCCTTAGTTTTCCGGAGGAGTGATCCTAATTACTCCAAGGTTCTTGCAAGAAGGGCGATTCGGGTGTTTGAGTTTGCTGATAAGCACCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990074
ATGATCACGCTTGTTCATAAAGTGCTGCAGGTTGGAGATGCCGGAAAGGATCACGCTTGTTGGGAAAGGCCCGAGGACATGGACACACCAAGAAGCGTGATCAAGATTGACAAGAACACCCCTGGCACAGAAGTTGCAGCTGAGACTGCTGCTGCTCTTGCTGCTGCTTCCTTAGTTTTCCGGAGGAGTGATCCTAATTACTCCAAGGTTCTTGCAAGAAGGGCGATTCGGGTGTTTGAGTTTGCTGATAAGCACCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770257.1
MITLVHKVLQVGDAGKDHACWERPEDMDTPRSVIKIDKNTPGTEVAAETAAALAAASLVFRRSDPNYSKVLARRAIRVFEFADKHRAAYSVGLRRYVCPYYCDFSGYQDELLWGAAWLHRATRNPTYLSYIQANGQTLGADEIDNTFGWDNKHVGARILLSKAYLVQNVQPLHDYKSHADNFICSLLPGTPYSSAQYTPGGLLFKMNDSNMQYVTSTSFLLVTYAKYLTTSRRVVNCGGAIIRMLSLWDNDKLRKCCVKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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