当前解析结果
SmilChr06G001479| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001479 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001479 |
| 描述 | zeatin O-glucosyltransferase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 15755666 - 15757307 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990164 |
|---|---|
| GeneID | 130990164 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990164 |
| 原始查询 | LOC130990164 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zeatin O-glucosyltransferase-like |
| 产物 | zeatin O-glucosyltransferase-like |
| Arabidopsis | AT3G50740 (UGT72E1)UDP-glucosyl transferase 72E1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824238] identity=38.6; qcov=0.609; evalue=1.06e-51; confidence=medium |
| Rice | Os04g0565400 (CZOGT3)- identity=41.3; qcov=1.01; evalue=5.63e-110; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00201 (UDPGT); PF26168 (Glyco_transf_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990164 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770362.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057770362.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770362.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770362.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770362.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:15755881 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr6:15755898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr6:15755959 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B24 |
Chr6:15755959 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr6:15756108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B45,B47,C17 |
Chr6:15756186 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr6:15756784 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B32 |
Chr6:15756784 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr6:15756944 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr6:15757020 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,C86 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057770362.1PF26168
Glyco_transf_N 15-245 aa
PF00201
UDPGT 255-392 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057770362.1 |
Pfam | PF26168 |
Glyco_transf_N | Domain | 15 | 245 | 8.2e-79 | 265.5 | Glycosyltransferase, N-terminal domain |
XP_057770362.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 255 | 392 | 5.5e-22 | 79.0 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。