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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001551`

染色体: Chr06 坐标: 16875685-16878803 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001551`
名称	SmilChr06G001551
描述	tubulin beta-5 chain-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16875685 - 16878803 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990227`
GeneID	`130990227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990227`
原始查询	`LOC130990227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubulin beta-5 chain-like
产物	tubulin beta-5 chain-like
Arabidopsis	`AT5G12250` (TUB6) beta-6 tubulin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831100] identity=97.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0413200` (TUB6) - identity=98; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005200 (structural constituent of cytoskeleton); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00091 (Tubulin); PF03953 (Tubulin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057770440.1`
2	Spindle pole	Spindle pole	0.60000	`XP_057770440.1`
3	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057770440.1`
4	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057770440.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16876062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B31,C43,C51,D5
`Chr6:16876278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B45,B75
`Chr6:16876425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:16876506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B77,C18,C23,C63
`Chr6:16876554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C27,C85,D4
`Chr6:16877125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:16877158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:16877284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B59,B84,C48,D2
`Chr6:16877306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B105,C34
`Chr6:16877482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B124,B19
`Chr6:16877532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:16877616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770440.1

446 aa

223

446

Tubulin

Tubulin_C

PF00091 Tubulin 3-211 aa PF03953 Tubulin_C 261-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770440.1`	Pfam	`PF00091`	Tubulin	Domain	3	211	5.5e-65	219.9	Tubulin/FtsZ family, GTPase domain
`XP_057770440.1`	Pfam	`PF03953`	Tubulin_C	Domain	261	382	2.7e-40	138.2	Tubulin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914457.1
ATAATGGAGAAATCGAAACTTCACTTTCTTAATCGGCCGATCCCATCTCAGCCGTCCATTACATAGATCAAATAGCTCATTAGAAATAGGAGGGAAATGATGAGAGCCGTCGATGACTGTGTCCACTGATATAAAATCACTCTTTAGGTCTGACAATTTCCTCACACGCTCTCTCTCACTCCACTCTCACTCTATCTTCGATCGAGTAGAGATACTTCTTACTCGATCACCTGTTGATTTTCCTGGTTCCTCTCGCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990227
ATGAGAGAAATCCTTCATGTTCAGGGAGGCCAGTGCGGGAACCAGATTGGTTCCAAGTTTTGGGAGGTTGTTTGTGAAGAGCATGGCATAGATCCAACTGGACGATATGCTGGTACTTCCGATTTGCAACTGGAGCGTGTCAATGTGTACTACAATGAGGCATCATGTGGCAGGTTTGTGCCTAGAGCAGTGCTTATGGATCTTGAGCCAGGAACCATGGATAGTGTCCGTACTGGACCATATGGTCAGATCTTCAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770440.1
MREILHVQGGQCGNQIGSKFWEVVCEEHGIDPTGRYAGTSDLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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