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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001566`

染色体: Chr06 坐标: 17104576-17107542 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001566`
名称	SmilChr06G001566
描述	70 kDa peptidyl-prolyl isomerase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17104576 - 17107542 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990241`
GeneID	`130990241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990241`
原始查询	`LOC130990241`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	70 kDa peptidyl-prolyl isomerase-like
产物	70 kDa peptidyl-prolyl isomerase-like
Arabidopsis	`AT5G48570` (AT5G48570) FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834913] identity=50.3; qcov=1.01; evalue=7.41e-176; confidence=high
Rice	`Os04g0352400` (OsFKBP62b) - identity=51.1; qcov=0.998; evalue=9.61e-179; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C); PF07719 (TPR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770453.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770453.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770453.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770453.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17105460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:17106353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:17106577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B52,B59,C48,D2
`Chr6:17106696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:17106705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:17106946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C46,C83,D3
`Chr6:17106961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:17107109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770453.1

512 aa

256

512

FKBP_C

TPR_2

PF00254 FKBP_C 36-125 aa PF00254 FKBP_C 151-238 aa PF00254 FKBP_C 268-333 aa PF07719 TPR_2 447-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770453.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	36	125	9.1e-55	183.7	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057770453.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	151	238	9.1e-55	183.7	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057770453.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	268	333	9.1e-55	183.7	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057770453.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	447	479	6.4e-13	48.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914470.1
AGTACATATCACCATTTTTTGTTTCGATTAATCGAATTTTTCGGTTCGGTAAATTCAGTTAACCGAAACCGAACCGCTTCCCACTTTAGTTAGTTATTTTTCACAGAGAAAAATCTTCAACTGAAAGACAATTTAAGGAGGGAAACTAACGACTTATCCTCAACTGAAATGCAATACAGACACACACCCTTATCTCTCCTCCCTTTCTCTCACTAGAAAAACTCCATTTCGAAACTGAAATGGAGAAGGAAGCGGCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990241
ATGGAGAAGGAAGCGGCGATTTCCTGCCACAAACCAATCTCAATTTTGCCCGAGACCAATCTTCAGCTACGCAAACAAATTATCCAAAAAGGGATTTCATGGCAAACTCCAATCCCAGGTGATGAAGTTGAAGTTCATTACCATGTGAGATTGCAAGAAGGGGGCTACTTGGATTCGAGTTGGGAGAGAGGGAGGCCTTTTAAGTTCAGATTAGGACAGTGTGAGGTGATAAAGGGATGGGATGAAGGGATTGGGACAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770453.1
MEKEAAISCHKPISILPETNLQLRKQIIQKGISWQTPIPGDEVEVHYHVRLQEGGYLDSSWERGRPFKFRLGQCEVIKGWDEGIGTMRKGERAVFTIPPVLAYGEAGSPPFVPPNSTLVFDVELISWCPIRDVCGDGGVMKKIVREGEGWATPNEADEVFVKYVAKDENGIVVSKCHEGLEFSLTNGHLCPAMSKAVRTMRKGEKAELSVKFSYGLIQSSRNDEMPPPHQNLIIYLELVSWNAVIDVKGDDSTVLKKITK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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