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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003170`

染色体: Chr01 坐标: 50497360-50503894 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003170`
名称	SmilChr01G003170
描述	phosphoinositide phosphatase SAC2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50497360 - 50503894 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990556`
GeneID	`130990556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990556`
原始查询	`LOC130990556`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoinositide phosphatase SAC2-like
产物	phosphoinositide phosphatase SAC2-like
Arabidopsis	`AT3G14205` (AT3G14205) Phosphoinositide phosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820638] identity=57.7; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0182400` - identity=57.6; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0043813 (phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0046856 (phosphatidylinositol dephosphorylation)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02383 (Syja_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770765.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770765.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057770765.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770765.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50497733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B14,C26
`Chr1:50497736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:50497748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr1:50497970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B14,C26
`Chr1:50497982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B107,B24,B40
`Chr1:50498912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C13
`Chr1:50499547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:50499554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B82
`Chr1:50500756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:50503398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B82
`Chr1:50503399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D6
`Chr1:50503432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770765.1

837 aa

418

837

Syja_N

PF02383 Syja_N 106-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770765.1`	Pfam	`PF02383`	Syja_N	Family	106	403	3.7e-82	276.8	SacI homology domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914782.1
GTAAAATATCGGCTACTTTTAAAAACGAAGACACCCAATAATTACACAGCTACAGAATAAAAAAAATATTATATTCCTTATTCTCTCTACACGCAAATTTTTTGTGGACGCAGTCGCCGGAGCTTTGCTTCTCAATCTTCTCTCTCGATCTACGCACAAAACGCCTTATTTCAATCTGCAGCCTCCTCTATCTGCAGCGCCACTCGCATATTTTCTGCTGTTACCGAAAATTTTCCGGATTTTTTTGCGATTTTTTAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990556
ATGGGAAGTATGGCGTTGGAGAATGACATTGAGGTTCCGTTCAATGCGGAGGCGAGCTCTGGAGACGTTGGCGGCGGAGGCGACGGCAAGTTTCAGAAATTCATGCTCTATGAAACTCGTTCGAACTTTTATATGTTTGGATTTGAGAGAAGAAAAAAGTACTGGAAAGTATTGAAGATAAGCAGATTAGAGCAGTCCGAGCTAAATGTTGTTGAAGATTCGACAATATACTCTCAGGATGAACAATCCGAGCTCCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770765.1
MGSMALENDIEVPFNAEASSGDVGGGGDGKFQKFMLYETRSNFYMFGFERRKKYWKVLKISRLEQSELNVVEDSTIYSQDEQSELLQRIADGNKSTGGLKFVTTCYGIVGFMKFLGPYYMIIITKRKKIGTICGHAVYSIAKSEMVPVPHSSMHSNMAYSKNENRYKKLLRNVDLTKDFFFSYSYHVMLSLQRNLSNHETGLSLYETMFVWNEFLTRGIRNQLKNSVWTVALVYGFFKQVKLSVSGHDFSLILIARRSRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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