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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003212`

染色体: Chr01 坐标: 50894465-50901242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003212`
名称	SmilChr01G003212
描述	non-functional NADPH-dependent codeinone reductase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	50894465 - 50901242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990911`
GeneID	`130990911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990911`
原始查询	`LOC130990911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-functional NADPH-dependent codeinone reductase 2-like
产物	non-functional NADPH-dependent codeinone reductase 2-like
Arabidopsis	`AT5G62420` (AT5G62420) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836363] identity=67.8; qcov=1; evalue=9e-158; confidence=high
Rice	`Os10g0114300` (OSJNBa0092N12.13) - identity=44.8; qcov=1; evalue=1.05e-87; confidence=medium
GO	GO:0004032 (aldose reductase (NADPH) activity); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771125.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771125.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057771125.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057771125.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:50894625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A11,A6,C54
`Chr1:50894625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A6,C54
`Chr1:50894645`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A20,A3,B1,B107,B118,B120,B125,B139,B29,B40,B7,B71,B72,B77,B84,B90,B92,B98,C33,C4,C47,C52
`Chr1:50894697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B135,B75,C39
`Chr1:50894723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B135,B75,C39
`Chr1:50894778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:50894823`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B104,B123,B133,B14,B40,B49,B66,B68,C26,C3,C62,C71,D11,D6
`Chr1:50895923`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A15,A3,A8,B139,B2,B42,B48,B52,B71,B73,B83,B91,C19,C4,C41,C55,C56,D5
`Chr1:50896009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A5,C61,C78
`Chr1:50896009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C61,C78
`Chr1:50896040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B76,B96,D7
`Chr1:50896063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771125.1

316 aa

158

316

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 17-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771125.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	17	285	1.7e-48	165.9	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915142.1
CAAATTGAAAGTAGAGAGATATAGAGAGAGAATGAGAAGCGATCAAGTAAGATTGAACAATGGCATCACTATACCATTACTTGGTATGGGAACTTACTCTTTCGAAAATCATAGCAAATCTACTGAGCATGCCGTCCAACTCGCCCTTAAGACGGGATACAGGCACTTCGACACTGCACGCATATACGGCTCGGAGGCAGCCTTAGGCAACGCGTTGAGCGACGCAATCTCAACCGGCGTCGTTCAGAGAGAAGATGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990911
ATGAGAAGCGATCAAGTAAGATTGAACAATGGCATCACTATACCATTACTTGGTATGGGAACTTACTCTTTCGAAAATCATAGCAAATCTACTGAGCATGCCGTCCAACTCGCCCTTAAGACGGGATACAGGCACTTCGACACTGCACGCATATACGGCTCGGAGGCAGCCTTAGGCAACGCGTTGAGCGACGCAATCTCAACCGGCGTCGTTCAGAGAGAAGATGTGTTCGTTACATCTAAACTGTGGGGAAGCCACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771125.1
MRSDQVRLNNGITIPLLGMGTYSFENHSKSTEHAVQLALKTGYRHFDTARIYGSEAALGNALSDAISTGVVQREDVFVTSKLWGSHHHDPVSALQKTLTIMGMEYIDMYLVHWPVRLKSWVCDPIPKEDEFEQLCLDVTWAGMEKCLDMGLCRGIGVSNFSSKKLQNLLDFASVPPAVNQVEMHPMWRQNKLRDFCSDHNIHVSAYSPLGGPGNLWGSTAVIESPLIKSMALKHRATPAQIALSWGLLKGASVIVKSFNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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