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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000091`

染色体: Chr07 坐标: 494687-497232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000091`
名称	SmilChr07G000091
描述	DNA repair protein XRCC4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	494687 - 497232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991287`
GeneID	`130991287`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991287`
原始查询	`LOC130991287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA repair protein XRCC4-like
产物	DNA repair protein XRCC4-like
Arabidopsis	`AT3G23100` (XRCC4) DNA ligase IV-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821885] identity=61.5; qcov=0.705; evalue=1.07e-94; confidence=high
Rice	`Os03g0740800` (XRCC4) - identity=58.8; qcov=0.702; evalue=9.09e-94; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005958 (DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex); GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining); GO:0006310 (DNA recombination); GO:0010165 (response to X-ray); GO:0032807 (DNA ligase IV complex); GO:0051103 (GO:0051103); GO:0051351 (positive regulation of ligase activity)
KEGG	smil03450 (Non-homologous end-joining - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06632 (XRCC4); PF21924 (XRCC4_CC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991287

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771387.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057771387.1`
3	Nuclear body	核内小体	1.00000	`XP_057771387.1`
4	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057771387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057771387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:494912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:494913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:494931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,C15,C32,C68,D8
`Chr7:494973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:494982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:494989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:494992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr7:495293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:495874`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr7:495874`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr7:496992`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B118,B136,B138,B17,B61,B66,B78,B90,B92,C30,C32,C46,C68,C71,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771387.1

332 aa

166

332

XRCC4

XRCC4_CC

PF06632 XRCC4 22-117 aa PF21924 XRCC4_CC 150-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771387.1`	Pfam	`PF06632`	XRCC4	Domain	22	117	4.8e-26	91.4	XRCC4 N-terminal domain
`XP_057771387.1`	Pfam	`PF21924`	XRCC4_CC	Coiled-coil	150	195	3e-07	31.2	XRCC4 coiled-coil

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915404.1
AAGCGGGAACTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAAGCTTCCTCCACACACCGCGCGCAGTGAGCTCAGCTCGCAGAAATTCATCGTCGAGGAAAATGGAAGCGCCGAAGCACACATGCTTGAAACTCGAAATAGCGATGGGCGGCGGCGAACCCGTACCCATTTTTGTGAAGGGTACATGGTACCCGACCCGCTTCGACCTTGCCATCACCGACGGCCACCGAGCTTGGACTTGCAACGCTACTGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991287
ATGGAAGCGCCGAAGCACACATGCTTGAAACTCGAAATAGCGATGGGCGGCGGCGAACCCGTACCCATTTTTGTGAAGGGTACATGGTACCCGACCCGCTTCGACCTTGCCATCACCGACGGCCACCGAGCTTGGACTTGCAACGCTACTGAGGAAGCGGTGGAGGAGAGAGCGTCGTATTGGGATCAAACGGCGTCGTACTACATTGACTTGGCCGAGAGGTATCTCGGATTTCAGCAACCCGGGTCGGTTTACGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771387.1
MEAPKHTCLKLEIAMGGGEPVPIFVKGTWYPTRFDLAITDGHRAWTCNATEEAVEERASYWDQTASYYIDLAERYLGFQQPGSVYGFSDAGDGCKRLSWTFEKEGMKLEWRWKCQPSPNSKATTVEVLDFLMDANIKLSEEVVWKSQSFDKLKLEAEKCLAQSEKLSSDKSEFESEIYGKFVQVLNSKKAKLRALRDRLSRQPSAENFPQEDEVSSDRTESLDEESDEERDRHSRRPPAVKKTDKEEVSSDRTESFDEEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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