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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000109`

染色体: Chr07 坐标: 604234-611898 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000109`
名称	SmilChr07G000109
描述	alpha-mannosidase I MNS4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	604234 - 611898 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991306`
GeneID	`130991306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991306`
原始查询	`LOC130991306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-mannosidase I MNS4
产物	alpha-mannosidase I MNS4
Arabidopsis	`AT5G43710` (AT5G43710) Glycosyl hydrolase family 47 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834391] identity=70.6; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0773600` - identity=74.5; qcov=0.879; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004571 (mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016020 (membrane); GO:1904380 (endoplasmic reticulum mannose trimming); GO:1904382 (mannose trimming involved in glycoprotein ERAD pathway)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01532 (Glyco_hydro_47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057771420.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057771420.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057771420.1`
4	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771420.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057771420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:604644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:604717`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C39
`Chr7:604717`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C39
`Chr7:604750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:604811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr7:604839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:604997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C21,C86
`Chr7:605164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:606074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C52,C62
`Chr7:606098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B139,B64,B95
`Chr7:606122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:606476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771420.1

630 aa

315

630

Glyco_hydro_47

PF01532 Glyco_hydro_47 43-469 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771420.1`	Pfam	`PF01532`	Glyco_hydro_47	Repeat	43	469	4.6e-117	392.5	Glycosyl hydrolase family 47

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915437.1
CACTTAGCCAAATTACAGAGTCATCTTCTCCCTCCTCAATTCACACACAGTCACACACACTAGAGATCTATGGGTGCTGCAAACAAGACTCTATTGCTAATTCTCCTACTATTTTCTGATCTTTTTGTATGCGAGATTCTCGCTGAAGGCGTCACTAAGGAGGAAGCCAAGCAGCTCAGAGATGAGGTGCGCGAAATGTTTTATCATGCCTTTGATGGATACATGAAGCATGCATTTCCACATGATGAACTGAAGCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991306
ATGGGTGCTGCAAACAAGACTCTATTGCTAATTCTCCTACTATTTTCTGATCTTTTTGTATGCGAGATTCTCGCTGAAGGCGTCACTAAGGAGGAAGCCAAGCAGCTCAGAGATGAGGTGCGCGAAATGTTTTATCATGCCTTTGATGGATACATGAAGCATGCATTTCCACATGATGAACTGAAGCCTTTATCGTGTGGAGGGGAAGATACACTCGGAGGATATGCATTAACATTGATTGATTCATTGGACACACTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771420.1
MGAANKTLLLILLLFSDLFVCEILAEGVTKEEAKQLRDEVREMFYHAFDGYMKHAFPHDELKPLSCGGEDTLGGYALTLIDSLDTLALLGDRERFSTSVEWIGKNLRFDINKTVSIFETTIRILGGLLSAHLIASDYNTGMRIPSYEDELLHLAEDLARRMLPAFDTPTGIPFGSVNLMHGVDENESKITSTAGGGTLTLEFGMLSRLTNDPIFEEVTKNAVLGLWARRSRINLVGAHIDVFSGEWTQKDAGIGTSIDSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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