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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003264`

染色体: Chr01 坐标: 51323635-51329953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003264`
名称	SmilChr01G003264
描述	chaperonin CPN60-like 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51323635 - 51329953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991410`
GeneID	`130991410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991410`
原始查询	`LOC130991410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperonin CPN60-like 2, mitochondrial
产物	chaperonin CPN60-like 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G13860` (HSP60-3A) heat shock protein 60-3A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820599] identity=76.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0540300` - identity=70.3; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0042026 (protein refolding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771613.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057771613.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771613.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771613.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51324356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B113,B33,C58
`Chr1:51324528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B74,C45,C56
`Chr1:51325416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B94,C8,C80,D6
`Chr1:51325628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:51325850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C2
`Chr1:51327126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:51327139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B71,B76,C23,D5
`Chr1:51328184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:51328690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:51328706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,D5
`Chr1:51329384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771613.1

573 aa

286

573

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 54-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771613.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	54	545	8.9e-69	233.2	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915630.1
AAAAAAACAAAGAGATGGAGTGTTTAATAGTTGATCCTTAAAATAAAAAAGAAATTAATGTGGAAAAAAGGTCAAAAGATATAGGGGTTTATGCTTTCCCTAATTATTTGGAAGCTTAAACCCTAGACCCCAAAATCTCCAGCTGCCACTTTTTACTGATACATTTTCTCTCCGGCGTAAAATCCTTTCAATTTTGCCATTGTTTTTCTAGCATCGTCATGTACAGGGTTACCGCCGCTGCTGTTGTTTCATCAATAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991410
ATGTACAGGGTTACCGCCGCTGCTGTTGTTTCATCAATAAGGTCCTCTGCTACGAGAAATCTGCTACGTAGTGGGGCTATCCATAGCAGAAACTACGCTGCCAAGGATATTTGTTTCGGTGATGGAGCTCGGGCAGCGATGCTTGCTGGAGTTAATGAACTCGCGGAAGCTGTAAAAGCGACGATGGGGCCGAAGGGTCGCAATGTAATTATTGAGAAACAAGGAAATCCCAAGGTTACAAAGGATGGTGTCACGGTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771613.1
MYRVTAAAVVSSIRSSATRNLLRSGAIHSRNYAAKDICFGDGARAAMLAGVNELAEAVKATMGPKGRNVIIEKQGNPKVTKDGVTVASSIEFSDNAKNLGANLVKQVAKATNNVAGDGTTCATVLAQAIFREGCKSVAAGVNVMDLRRGINMAVEAVIADLKRRALMISTPEEITQVATISANGEREIGELLARAMEKVGKEGVITVSDGNTMDNELEVVEGMKLTRGYISPYFITDSKTRKCELENPLILIHEKKISDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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